SNPs marker是全基因组范围应用广泛的分子标记，本文介绍生态基因组学中利用GATK4软件进行SNPs calling的流程（人的研究中可能略有不同）。以下所有分析过程...
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SNPs calling流程（GATK4）
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除了GO基因本体论，还有PO、TO、CO等各种Ontology？我们最常用最熟悉的功能数据库之一：GO（gene onotology），基因本体论。其实是一套标准词汇术语，目的是从不同角度来描述某个基因的特点和功能，三大本体如生物学进程（...
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eQTL就那样～（1）前言 我还未想到这个专题叫什么...... 暂定“XXX就那样”？ 我们先来个斗鸡眼，看着一下中间的QT。 1.什么是数量性状？（quantitative trait，QT）...
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个人网站建设日记第1篇2022-08-03
今天我的个人网站提交的备案已经通过服务商提交管局审核了，静待7-20个工作日内早点通过审核获得备案号。 接触网络已有21年了，21年前的一个晚上，和师范同学带着猎奇的心理跑到...
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GWAS分析-说人话（20）-单倍体关联分析前言 来到这里，已经渐渐不是人话了... 估计这辈子我也没有想到，我把我最厌恶的东西写出来， 居然是最多人看的...... 分析方法很多，这一小节吐槽官网的这一行代码，大神请...
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R使用笔记：相关系数:cor.test();corr.test();rcorr()本次笔记内容：cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}spearmanCI() {spearmanCI} spea...
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R语言-多线程并行化任务计算(分发计算任务到多个cpu内核)R语言运行在CPU单核单线程上，提高计算效率可以通过并行包： 实现,该包属于base包，不需要额外安装。 函数是 lapply 的并发版本，可以自定义进程数发挥多CPU核心的...
