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基于Seurat 整合分析创建“共现热图”（co-occurance）通过 共现热图(co-occurance heatmap)，我们可以用数值的方法定量地检查两个数据集的重叠程度。基于“最小值和”计算的重叠分数，...
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基于GWAS结果的SNP筛选与坐标检索指南
1、关于潜关联SNP的筛选 筛选疾病风险SNP时，选择GWAS p值小于0.05的结果 并不是一个最佳的策略，尤其是在全基因组范围的关联分析中。...
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Seurat::DoHeatmap Clustering Specific GenesReference DoHeatmap clustering specific genes and not top x genes · Issu...
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利用 DuckDB 在 Linux 上高效查询多种结构化数据
DuckDB 主要是为结构化数据查询设计的，专注于高效处理和分析大规模数据集。它支持多种流行的数据存储格式，如 Parquet、CSV 和 SQ...
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Seurat v4 与 v5 数据整合工作流的技术差异说明批次效应 是指在实验中由于不同的实验条件、操作人员、试剂批次、设备差异等非生物学因素引起的系统性差异。具体来说，在单细胞RNA测序（scRNA-...
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Human-to-Macaca fascicularis Ortholog GenesEnsembl webpage[http://www.ensembl.info/blog/2009/01/21/how-to-get-all-t...
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Signac::Enhence_CoveragePlot 的参考实现方案效果图 Signac中的 CoveragePlot是一种用于展示基因组覆盖度的图形工具，常用于 ATAC-seq（Assay for Trans...
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Pianno: 空间转录组组织域无监督注释工具的安装教程软件快照: https://github.com/yuqiuzhou/Pianno[https://github.com/yuqiuzhou/P...