挖掘GEO芯片时会发现多个类似的研究,那么怎么把它们整合到一起呢?常见的分析方法: 差异分析→直接求交集 去除批次效应 Robust Rank Aggregation(RRA...
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轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
WGCNA原理和分析流程[https://www.jianshu.com/p/9331eb5377d1] 使用pbmc数据集做演示,使用矩阵是@data矩阵,基因是2000高...
说在前面 生信宝库在之前的两期推文:CBNplot:可视化富集通路中基因的调控关系[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1...
说在前面 Immugent在之前一篇推文中:CBNplot:可视化富集通路中基因的调控关系[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5...
说在前面 相信大家在平时做富集分析时都会有这样的一个需求:如果能知道感兴趣的某条通路中各基因的调控关系,那么就能准确识别出hub基因;或者说找到我们感兴趣的基因在这条通路中的...
hello,大家好,这一篇给大家带来的是10X单细胞和10XATAC联合进行网络调控的分析,也很经典,参考的文献在IReNA: integrated regulatory n...
scRNAtoolVis 2022-07-11 scRNAtoolVis 0.0.3 版本更新https://mp.weixin.qq.com/s/Dhp7uCcj2a7...
前言 说到对单细胞数据进行细胞周期评估,很多小伙伴都会觉得这是一步无关紧要的步骤,做不做都无所谓,就算是做了也会将它作为混杂因素在细胞聚类之前给去除。但是事实上,我们对细胞周...