写在前面 天气开始暖和了☀️，发现旅游的人好多啊！~🥲 不知道自己什么时候能有时间出去看看外面的世界，实在是太忙了。😷 最近用到的有个包感觉很不错，分享给大家，funkyhe...
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🤩 funkyheatmap | 用这个包来完美复刻Nature Biotechnology的高颜值神图吧！~ -
【三维基因组】浅谈三维基因组多组学联合-part6Job dekker曾说 一切皆没有意义，除了在三维结构的前提下。那么对于三维基因组学多组学联合分析而言，我们也有一套以三维基因组学的中心法则。 首先，通过全基因组的层面上比...
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结合这个研究热点，竟然发了15分的SCI
今天分享一篇m6A方向的15分+SCI文章，研究框架：***基因通过靶向N6-甲基腺苷结合蛋白***抑制***的发生发展。这篇文章发表在Molecular Cancer上，属...
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NGS原理- 单细胞转录组测序-横评13种单细胞测序以及单细胞核测序方法来源于 Benchmarking single-cell RNA-sequencing protocols for cell atlas projects 对比了13 com...
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Aspera 上传基因组数据到NCBI
完成基因组后，需上传数据，比如到NCBI，这一步可以选择Aspera进行操作 上传基因组或者原始数据一般流程如下 1、 注册NCBI账号 https://www.ncbi.n...
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已经做完GO enrichment,例如david结果, ggplot2可视化有一些已经做完了GO enrichment, 得到了结果，才发现很多软件都是直接给gene list做富集。如果已经完成分析，照样可以画图，代码如下： 原始文件示例：Anno...
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Rose软件寻找超级增强子
（1）这个前提是已经用Macs2寻找到了peaks, 很多人可能不明白一些人写的怎么将bed文件转化为.gff文件，其实根本不用，我们直接将Name_peaks.narrow...
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hic分析之分步工作原理参考之前的文章 hic分析之 hic-pro 介绍与安装 分步工作原理： 先看test文件 再看看opt文件 工作原理介绍： 1.Reads Mapping 将fastq文...
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如何使用ChromHMM鉴定染色质状态趁着零碎的时间整理了下ChromHMM的相关内容。 ChromHMM是基于ChIP-seq组蛋白数据检测染色质状态的工具。 基因组区域特定的组蛋白修饰或修饰的组合具有特定的功...
