240 发简信
IP属地:山东
  • Resize,w 360,h 240
    Intervene: BED文件的intersect和绘制韦恩图

    一、背景介绍 通常,BED文件的overlap/intersect的操作,可以BEDtools intersect功能完成overlap和统计:...

    2.7 8641 3 26
  • Resize,w 360,h 240
    如何理解BAM文件的flags

    每次遇到BAM文件flag值都有一些困惑,时间越久越迷惑。在此,针对BAM文件中的flag信息进行梳理和解释: 记录于BAM文件的第2列,以bw...

  • Resize,w 360,h 240
    BETA转录因子与表达关联分析

    今天介绍和测试这款关联ChIP-seq、RNA-seq分析软件,BETA(Binding and Expression Target Analy...

  • HMMRATAC检测ATAC数据的开放性

    背景 目前,已经衍生出多种用于检测染色质开放性的试验方法。比如, DNase-seq, FAIRE-seq和ATAC-seq,其中ATACA-s...

  • Resize,w 360,h 240
    PacBio数据拆分之lima

    一、背 景 PacBio最新三代测序仪Sequel II芯片实现了更高通路,同时已经支持barcode测序,这样方便混合多个组织、处理、物种等...

  • 转|Dockerfile构建镜像

    发现一篇帖子很受用,转载至此,别无它用,侵删。 一、关于 Dockerfile 我们知道 Docker 镜像的生成方式有两种,一种是基于现有容器...

  • Resize,w 360,h 240
    了解GRO-seq

    什么是GRO-seq? 来自灵魂的拷问 GRO-seq(Global nuclear Run-On sequencing)是一种专门测量新生RN...

  • 基于富集的5fC测序分析思路

    一、过滤与质控 测序获得一对fastq文件,命名为treatment和control,各含两个生物学重复,即:treatment_1、treat...

  • ChIP-seq分析的数据标准

    以下罗列了ChIP-seq数据分析中的ENCODE标准,针对不同的免疫共沉淀类型有不同的标准,以下从组蛋白和转录因子2个方向介绍: 一、组蛋白 ...