基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非常重要的来源，...
发简信
IP属地：北京
-
群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全 -
小麦网页版分析KEGG和GO一、KEGG分析 通过这篇文章上的网站进行小麦的KEGG分析 1）点击analyze data 2）粘贴自己的基因名称数据 3）提交数据并进行分析 4）查看mapping到的...
-
-
植物图形泛基因组Graph-based pan-genome图形泛基因组（图泛）以节点和路径的形式存储和展示物种的变异信息，关键作用是扩展线性参考基因组的坐标系统，以容纳更多的遗传多样性区域。本文首先总结了图泛构建方法，然后讨论了图泛...
-
GO-plot:超好看的GO富集可视化以下代码均来自GO-plot的manual（GOplot (wencke.github.io)[https://wencke.github.io/]）。GO-plot用条形图...
-
群体适应性分析——选择信号●选择信号：生物在自然选择或人工选择过程中，由于选择作用在基因组上留下的遗传多态性降低、连锁不平衡等选择印记。●选择性清除（selective sweep）：受选择基因座位的...
-
基于单体型haplotypes的群体选择信号的检测——EHH & iHS
基于单体型haplotype的选择信号的检测。在selective sweeps选择过程中，有些强烈受到选择的位点variants由于LD的因素会连带着其附近的位点varia...
-
R绘图：ggplot2绘制火山图火山图是测序分析报告中最为核心的图片之一。绘制火山图的方法有许多，Excel和第三方软件等，本文主要运用ggplot2和ggrepel两个R包演示[1][2]。横坐标为Fol...
-
我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
-
@26dfe547c084 分子标记数据，可以看看QTL定位相关的软件。
GWAS全基因组关联分析：TASSEL 5.0 Windows版软件使用教程
TASSEL的官方网站：https://tassel.bitbucket.io/[https://tassel.bitbucket.io/]在TASSEL的下载文件夹中......
-
@2b13d4e31a3c https://tassel.bitbucket.io/ 在这里应该可以下载
GWAS全基因组关联分析：TASSEL 5.0 Windows版软件使用教程
TASSEL的官方网站：https://tassel.bitbucket.io/[https://tassel.bitbucket.io/]在TASSEL的下载文件夹中......
-
@晓晓_71d9 CMplot、qqman等很多包都可以绘制曼哈顿图，软件的说明中有很详细的代码。
GWAS全基因组关联分析：TASSEL 5.0 Windows版软件使用教程
TASSEL的官方网站：https://tassel.bitbucket.io/[https://tassel.bitbucket.io/]在TASSEL的下载文件夹中......
-
堆积柱形图（stacked barplot）展示密码子偏向性的RSCU值研究密码子偏向性的论文通常都会分析RSCU值，论文中通常会用堆积柱形图来展示RSCU的值，之前在论文里也看到过下面这幅图的形式展示RSCU分析的结果 之前也有人在公众号留言问...
