一、KEGG分析 通过这篇文章上的网站进行小麦的KEGG分析 1）点击analyze data 2）粘贴自己的基因名称数据 3）提交数据并进行分析 4）查看mapping到的...
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小麦网页版分析KEGG和GO -
植物图形泛基因组Graph-based pan-genome图形泛基因组（图泛）以节点和路径的形式存储和展示物种的变异信息，关键作用是扩展线性参考基因组的坐标系统，以容纳更多的遗传多样性区域。本文首先总结了图泛构建方法，然后讨论了图泛...
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暂别简书，后会有期
我不是老师，也不是大神，更不是前辈。我只是个普通的科研工作者，一个只想努力变得更好的人。 来到简书快3年了，期间写了不少的笔记。很多的笔记是在疫情严重时wfh的时候写的。至今...
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GO-plot:超好看的GO富集可视化以下代码均来自GO-plot的manual（GOplot (wencke.github.io)[https://wencke.github.io/]）。GO-plot用条形图...
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群体适应性分析——选择信号●选择信号：生物在自然选择或人工选择过程中，由于选择作用在基因组上留下的遗传多态性降低、连锁不平衡等选择印记。●选择性清除（selective sweep）：受选择基因座位的...
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基于单体型haplotypes的群体选择信号的检测——EHH & iHS
基于单体型haplotype的选择信号的检测。在selective sweeps选择过程中，有些强烈受到选择的位点variants由于LD的因素会连带着其附近的位点varia...
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R绘图：ggplot2绘制火山图火山图是测序分析报告中最为核心的图片之一。绘制火山图的方法有许多，Excel和第三方软件等，本文主要运用ggplot2和ggrepel两个R包演示[1][2]。横坐标为Fol...
