火山图是测序分析报告中最为核心的图片之一。绘制火山图的方法有许多，Excel和第三方软件等，本文主要运用ggplot2和ggrepel两个R包演示[1][2]。横坐标为Fol...
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R绘图：ggplot2绘制火山图 -
单组火山图和多组火山图展示差异表达基因（DEGs） 2023-10-12前言 在各种RNA测序数据中，我们几乎都避不开差异表达基因（DEGs）的分析。我们可以用气泡图，提琴图和热图等展示不同细胞亚群或样本的差异基因表达情况，而火山图则是最直观的表...
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和火山图杠上了---复现SCI文章火山图这次真的和火山图杠上了，我就不信了还复现不完奇奇怪怪的火山图？在一篇文章中看到了一种呈现方式，其实大同小异，但是还是练习下有些画法。此外，小伙伴们又看到新奇的火山图，可截图联...
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结合Seurat批量去除环境RNA污染（SoupX）2022-05-19相似关键词 背景RNA，环境RNA，RNA污染，游离RNAbackground mRNAs, ambient RNA, RNA contamination, cell fr...
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10Xvisium HD高精度平台探索作者，Evil Genius 看到最近的反馈，大家似乎对相亲的事情很感兴趣啊，😄，但是大家别光顾笑啊，女孩子想想自己30多岁会不会也是这样，男孩子30多了想想遇到这样的女人该...
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Seurat官方教程|CITE-seq, RNA + ADT的WNN分析Compiled: March 18, 2021 原文链接：https://satijalab.org/seurat/articles/weighted_nearest_ne...
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团队作案HEK293，史上最强搬砖细胞293细胞不是一个人在战斗 对于做分子生物学实验的人来说，293细胞再熟悉不过了。常在文献中看到不同的293名字，全然没考虑过293细胞原来还是团队作案，分身无数。 293细...
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(Smartseq2) single cell RNA-seq分析练习这次跟着课程（Smartseq2 scRNA小鼠发育学习笔记-1-前言及上游介绍）要练习的文章是：Dissecting Cell Lineage Specification ...
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跟着Cell学单细胞转录组分析(十一):单细胞基因评分|AUCell评分
更多精彩请至我的公众号《KS科研分享与服务》 第一次接触基因评分是在一篇文章中，也不知道这样的叫法对不对，作者选定了几个炎症基因，利用seurat包的一个打分函数AddMod...
