比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
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比较基因组学分析2：基因家族收缩与扩张分析 -
Chocolatey初体验
新电脑安装Nodejs时发现安装包提示是否自动安装Chocolatey，之前没看到过这个名词，于是搜索了下，发现Chocolatey是Windows平台的包管理工具，类似于L...
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hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
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make lastz chain的slurm配置
找到nextflow_wrapper.py这个文件的这几行： 然后根据自己的服务器情况进行修改；如果服务器有单次提交任务数限制，增加一行executor.queueSize ...
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比较基因组学Cactus初探
11.21更新，本文内容包括Cactus进行无参基因组比对的详细教程。 你说的对，但是Cactus是一款开源的，发表过正刊的，高度权威的基因组比对软件.jpg Cactus是...
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生信分析18：如何鉴定选择清除区域文献18中，作者用了很大篇幅去鉴定各个亚群的受选择区域，然后与其性状关联。本次推送将介绍如何进行选择清除分析。 相关概念 选择即有条件的筛选，在群体研究中可以分成自然选择和人...
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ROH、近交系数、亲缘系数、IBD、IBS连续纯合片段（runs of homozygosity, ROH）是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的，基于ROH计算的基因组近交系数是个体真实的近交系数，它比传统系谱...
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关于PhastCons和SIFT4G的使用
由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列，以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性，经过一段时间的探索，对这两款软件已经有了还算全面的认识，在此记录一下分...
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比较基因组学分析3：特异节点基因家族富集分析（非模式物种GO/KEEG富集分析）比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
