养猪场小老板

TCGA数据挖掘 步骤1：安装R包 接下来，进行分析 关于数据种类，有count类型，肯定选count，次选才是fpkm等其它。 当拿不到count数据时，可以采用其它的。如...

Amy_Cui

MACS的自述文件（2.1.2） 运行 结果 介绍 随着测序技术的改进，染色质免疫沉淀，然后进行高通量测序（ChIP-Seq）越来越受欢迎研究全基因组蛋白质-DNA相互作用。...

尘世中一个迷途小书僮

整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 deeptools 提供两个bam转换为bw的命令，分别是bamCove...

小洁忘了怎么分身

前言 我是在y蜀黍的书里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一个叫msigdbr的包，就是把MsigDB的那些基因集合都R语言化了。那么以后想做G...

黄晶_id

这是我听B站鲮鱼不会飞视频（GO，KEGG，DO富集分析）里的笔记哦~当然有的地方加上的是我自己的理解，如果哪里和视频上讲的不一样那是我自己发挥的，自行忽略.... 市面上公...

SYSU星空

Fastq格式 二代测序平台获得的原始数据为fastq（或为压缩文件fq.gz）格式，包含双末端测序所得的正向和反向两个文件（通常用“1”和“2”来区分），如下所示： 每一个...

生信start_site

在分析TCGA数据库里的RNA-seq数据之前，先了解一下TCGA样本的id名称里的小秘密：参考文章：TCGA的样本id里藏着分组信息 根据文章里的内容，我查看了前一篇文章里...

胡童远

本文摘自：R 语言主成分分析(PCA)实战教程[https://mp.weixin.qq.com/s/uQPCPh09XXQiz9Iau9p5Fg]方便个人学习和查阅 安装依...