单细胞分析流程之Cell Ranger 相信做单细胞的小伙伴对Cell Ranger这个软件都不陌生，我们今天就来了解一下Cell Ranger的安装和使用方法。Cell R...
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单细胞转录组流程一：安装运行cellranger及结果解读
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适用于scRNA-seq的细胞通讯工具-1：CellphoneDB先记录一下，我安装过程的惨痛经历😭，希望小伙伴们避免像我一样入坑。起初每一次安装，不论是使用conda还是pip工具，发现安装好的CellphoneDB（4.0.0）在she...
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cellphoneDB呕心沥血下载安装教程
我安装了一天之后快哭了，然后去100块买了个老师指导生信自学要么哭要么花钱，就是我这个垃圾1、安装https://github.com/ventolab/CellphoneD...
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CellphoneDB V5CellphoneDB工具通过利用我们的CellphoneDB数据库中与单细胞转录组数据交互的分子，提供不同的方法来评估不同细胞类型之间的细胞间通讯。 v5 的新特性 新的P...
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单细胞分析之细胞交互-1：CellphoneDB常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...
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10X空间转录组分析之空间模式与共定位hello，大家好，又是周五，一周又将过去了，时间总是匆匆，片刻不停留，我们唯一能做的，就是在时间流逝的过程中，留下点印记，虽然我们穷，找不下对象，但是过的开心也是成功~~~...
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DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap绘制带特定基因的单细胞热图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
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DoHeatmap画热图时应该注意的点日常瞎掰 通过标题大家已经知道今天我们分享的主要内容了。DoHeatmap这个函数来自于Seurat包，处理过单细胞的人应该都知道这个函数就是用来画每个cluster的m...
