lftp代码那里星号是密码不是用户名
使用LFTP+FileZilla向GEO数据库上传数据写在前面向GEO数据库中上传高通量测序的文件可能是一个人研究生阶段必须要经历的过程，如果不太了解高通量测序也不具备linux基本操作的话，可能会费一番工夫。我采用的是LFTP...
IP属地：甘肃
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科研阿红 ·
统一回复，希望能帮到大家：query时2) Query parameters选择数据库latest就会出现detailed list和heatmap不对的情况，但是选择1.0就没问题！
广而告之！ -
大佬你有什么医学生信分析的交流群可以分享下吗😂最近刚开始学，问题比较多
wilcox.test 进行 RNAseq 差异表达基因分析
如果拿到的表达谱不是原始的read counts数据而是TPM值，就不能用包（比如DESeq2）来进行差异表达基因分析。我们可以手动用wilcox.test 函数手动进行分析...
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你好我想问一下，我下的数据作者文章里说是PE，但是转换完了也还是只有一个文件这是怎么回事，miRNA-seq的文件
fastq-dump从SRA文件中提取fastq文件
fastq-dump是SRAtoolkit中使用频率很高的命令，用于从SRA文件中拆解提取fastq文件。具体用法如下： 一. 拆解一个sra文件 SRR6232298.sr...
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就是直接分析是吧
wilcox.test 进行 RNAseq 差异表达基因分析
如果拿到的表达谱不是原始的read counts数据而是TPM值，就不能用包（比如DESeq2）来进行差异表达基因分析。我们可以手动用wilcox.test 函数手动进行分析...
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楼主楼主我想问下，我从geo下的RNA-seq的表达矩阵，里面geneid里有很多不是用ensg命名的，这些行该咋处理，有很多是和genename一样的行。
wilcox.test 进行 RNAseq 差异表达基因分析
如果拿到的表达谱不是原始的read counts数据而是TPM值，就不能用包（比如DESeq2）来进行差异表达基因分析。我们可以手动用wilcox.test 函数手动进行分析...
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你好楼主，我是直接从geo下载的作者上传的expression.xlsx文件，里面的gene_id里面有很多费ENSG命名的ID还有类似于AA174084这种类型的ID，这些id能转换吗？还是直接删除掉只保留ENSGID的行呢？
一个RNA-seq实战-超级简单-2小时搞定
这是原帖http://www.bio-info-trainee.com/2218.html[http://www.bio-info-trainee.com/2218.html...
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请问楼主，我直接从geo下载的作者上传的expression.xlsx文件，里面的gene_id里面有很多费ENSG命名的ID还有类似于
AA174084
AB447886
AB458446
这周类型的ID，这些id能转换吗？还是直接删除掉只保留ENSGID的行？RNAseq数据，下载GEO中的FPKM文件后该怎么下游分析
这个推文已经发布在生信技能树公众号： RNAseq数据，下载GEO中的FPKM文件后该怎么下游分析 文献标题是:Oncogenic lncRNA downregulates ...
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哦哦好吧
Rprofile -- 自定义你的R启动方式
Rprofile 文件位于R安装目录下的library/base/R/Rprofile，没错，是在base包下面。 相当于配置文件的功能，打开之后可以看到预设了很多东西，比如...
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@正经昵称征集中 链接好像坏掉了=。=
Rprofile -- 自定义你的R启动方式
Rprofile 文件位于R安装目录下的library/base/R/Rprofile，没错，是在base包下面。 相当于配置文件的功能，打开之后可以看到预设了很多东西，比如...
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@正经昵称征集中 灰常感谢！
Rprofile -- 自定义你的R启动方式
Rprofile 文件位于R安装目录下的library/base/R/Rprofile，没错，是在base包下面。 相当于配置文件的功能，打开之后可以看到预设了很多东西，比如...
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我的ubuntu20.04的前几天运行的时候正常的，后来一天突然报错了，中级安装了其他的包可能信息不知道哪里给覆盖了，然后直接conda重装fastqc就好了
使用java命令出现Error: A JNI error has occurred, please check your installation and try again的错误
运行Java程序，javac运行.java文件没有报错，但java运行的时候报错 仔细看一下报错 执行 java -version 和 javac - version 一下发...
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你好我想问下那个colorout的包是从哪里安装的，我看R官网说是没有新版的了，被从镜像库里移除了只有旧版的了
Rprofile -- 自定义你的R启动方式
Rprofile 文件位于R安装目录下的library/base/R/Rprofile，没错，是在base包下面。 相当于配置文件的功能，打开之后可以看到预设了很多东西，比如...
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Linux下载安装featureCounts软件下载软件 二进制版本的软件解压就可使用 解压后进入文件夹的bin 运行这个软件就是带上全部路径 运行后出现了帮助文档，就是代表安装成功可以使用
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CIBERSORT 免疫浸润(2023.1.2更新版)目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea，今天介绍CIBERSORT。 1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT的介绍 Importantly...
