TRF软件是基因组注释中常用于检测序列中串联重复序列的软件，无需安装，使用简单方便。 1. 重复序列分为串联重复序列和散在重复序列（转座子）； 串联重复序列又包含卫星序列 >...
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TRF--Tandem Repeat Finder -
BUSCO - 组装质量评估BUSCO - 组装质量评估软件 BUSCO - Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs 额。直译的话就是普遍通用的单拷贝直...
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Rosetta 简易手册这部手册的基本思路（如何使用我） 在 Rosetta入门 这一部分，我记录了Rosetta能够解决的生物问题及其使用的抽样策略，主要包括：如何将你的问题转化为Rosetta可...
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未来药物开发机遇—Druggable Genome
很多生物医学研究以及新疗法的开发都集中于极少部分人类基因组，还有相当多与疾病相关的蛋白有待开发，这其中其实蕴藏了很多科研与商业机会。NIH启动可成药基因组项目(Druggab...
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使用HINT-ATAC进行ATAC-Seq的footprinting分析关于ATAC-seq分析，在网上看到两篇关于同一片综述的翻译，写的很好：ATAC-seq数据分析工具的比较和推荐（Genome Biology综述）ATAC-seq生信分析综...
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CUT&RUN实验原理和步骤这篇笔记是记录CUT&RUN实验的具体步骤。因为下周就要做CUT&RUN了，首先就要先熟悉一下实验步骤。虽然有纸质版的protocol，但是老板推荐我去试剂盒官网看一下视频，...
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免疫细胞注释-2：髓系细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...
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免疫学笔记-1 | T细胞分化发育及其Marker1 关键细胞类型或Marker缩写： 骨髓多能造血干细胞 HSC 淋巴样祖细胞 lymphoid progenitor cell T细胞抗原识别受体 TCR 抗原提呈细胞 A...
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10X单细胞、单核、空间转录组揭示肿瘤-微环境的空间结构与调控网络hello，大家好，今天我们继续来分享关于10X空间转录组在肿瘤方面的研究，其实也和大家分享过很多次了，强调肿瘤正常边界的重要医学意义，而如果实现这个，就必须借助空间转录组技...
