轻轻松松的完成数据分析,高高兴兴的发论文,一个完美的PCA分析流程呈现给各位,喜欢请关注,点赞;后面的内容更精彩!!! PCOA分析 可以通过以下代码添加置信区间与标签 NM...
公众号后台有读者留言问这个图的实现办法,这个图相比于普通的PCA散点图是多了一个垂直和水平的误差线,这个如何实现之前还没有尝试过,所以查了查资料,找到了一个参考链接 http...
微生物群落研究的主要目标是比较不同群落的组成(β多样性)。在第6章介绍了β多样性,并举例说明了如何计算β多样性指数。得到β多样性指数后,可以对其进行统计分析。微生物群研究中的...
R有自己的计算样本距离(dist)和聚类(hclust)的方法/函数,各自包含多种算法据数据特征选择。另外在生态学vegan包vegdist函数也可计算距离,包含多种生态常用...
之前写过一篇细胞类型注释的推文:单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释[https://www.jianshu.com/p/1887dbd8d9e4],里面介绍了...
前面已经讲解了:单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing[https://www.jianshu.com/p/02b70bda5d0a]单细胞分析实录(2): 使...
这里以火山图为例进行说明,在转录组分析中,火山图是很常见的一类图,纵轴表示p_value,横轴表示log (fold change)。单一的散点图绘制很简单,火山图比较难处理...
最近好几位读者在公众号后台留言PCoA。今天的推文就来简要的介绍一下PCoA在R语言里实现的代码。具体的原理我自己也没有看明白。目前的理解是:这个PCoA(主坐标分析)和主成...