大家好，本周给大家分享的是一篇2020年9月17日发表在nature communication上使用ATAC-seq实验数据探究牛胚胎染色质重...

大家好，本周给大家分享的是一篇2020年6月2日发表在Cell Host and Microbe上使用比较基因组学解析毛螺菌科分离株之间的功能和...

我们将微生物群落组成研究分为两个主要部分：(1)分类多样性、OTUS和类群的假设检验；(2)类群间差异分析。第一个成分主要属于单变量群落分析。第...

步骤1：以适当的格式加载和读取OTU表：设置目录的方式与我们在前几章中所做的相同。“td_OTU_tag_mapped_lineage.txt”...

10.1 Introduction to Compositional Analysis（成分分析导论） ①什么是成分数据？ 根据韦伯斯特第二版新...

微生物群落研究的主要目标是比较不同群落的组成(β多样性)。在第6章介绍了β多样性，并举例说明了如何计算β多样性指数。得到β多样性指数后，可以对其...

Redundancy Analysis (RDA)：与三种基本排序方法相对应，vegan包有三种版本的约束排序：冗余分析(RDA，与主成分分析相...

微生物群落组成的研究方法可以分为两大类：分类多样性分析和微生物群落组成的多元分析。多变量分析包括各种多变量技术，如聚类和(无约束和有约束的)排序...