轻轻松松的完成数据分析，高高兴兴的发论文，一个完美的PCA分析流程呈现给各位，喜欢请关注，点赞；后面的内容更精彩！！！ PCOA分析 可以通过以下代码添加置信区间与标签 NM...
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微生物多样性qiime2分析流程(11) 数据可视化分析(中) 之PCA,PCOA,NMDS分析 -
R语言ggplot2给PCA散点图结果上添加水平和垂直误差线公众号后台有读者留言问这个图的实现办法，这个图相比于普通的PCA散点图是多了一个垂直和水平的误差线，这个如何实现之前还没有尝试过，所以查了查资料，找到了一个参考链接 http...
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第九章 多变量群落分析1微生物群落研究的主要目标是比较不同群落的组成(β多样性)。在第6章介绍了β多样性，并举例说明了如何计算β多样性指数。得到β多样性指数后，可以对其进行统计分析。微生物群研究中的...
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R: 距离，聚类，建树R有自己的计算样本距离(dist)和聚类(hclust)的方法/函数，各自包含多种算法据数据特征选择。另外在生态学vegan包vegdist函数也可计算距离，包含多种生态常用...
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单细胞分析实录(14): 细胞类型注释的另一种思路 — CellID
之前写过一篇细胞类型注释的推文：单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释[https://www.jianshu.com/p/1887dbd8d9e4]，里面介绍了...
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单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释
前面已经讲解了：单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing[https://www.jianshu.com/p/02b70bda5d0a]单细胞分析实录(2): 使...
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R绘图(3): 散点图添加文本注释
这里以火山图为例进行说明，在转录组分析中，火山图是很常见的一类图，纵轴表示p_value，横轴表示log (fold change)。单一的散点图绘制很简单，火山图比较难处理...
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R语言做主坐标分析（PCoA）的一个简单小例子最近好几位读者在公众号后台留言PCoA。今天的推文就来简要的介绍一下PCoA在R语言里实现的代码。具体的原理我自己也没有看明白。目前的理解是：这个PCoA(主坐标分析)和主成...
