发简信
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2021-07-13 R包安装出错与解决方法win10系统 刚装好R和Rstudio，R版本为4.0.0时，需要安装Rtools https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtool...
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错误提示：Error in structure(.External(.C_dotTclObjv, objv), class = "tclObj")
解决办法：
$chooseCRANmirror(graphics=F)R包安装出错，提示package‘latticeExtra’isnotavailable(forRversion3.5.1) 的解决方法。(一个生信小白的血泪史)
最近疫情在家没事就开始学习R语言，之前在安装后加载包时很多都会提示有一些小包没有安装，这时候直接安装小包就可以成功加载目的R包了～ 但是，在安装DEseq2时出现了问题： 下...
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$ conda install bioconductor-deseq2
R包安装出错，提示package‘latticeExtra’isnotavailable(forRversion3.5.1) 的解决方法。(一个生信小白的血泪史)
最近疫情在家没事就开始学习R语言，之前在安装后加载包时很多都会提示有一些小包没有安装，这时候直接安装小包就可以成功加载目的R包了～ 但是，在安装DEseq2时出现了问题： 下...
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收藏贴-基因/蛋白功能注释、富集分析在线工具详解
Metascape网站（http://metascape.org ）是一个能对基因或蛋白质列表进行注释和富集等分析的在线工具，除了传统的GO注释和富集之外还提供的蛋白质互作分...
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R语言实现蛋白质相互作用网络——PPI可以用网页版做，但有上限2000个基因的限制。所以今天开发一下怎么用R飞一波。 1. 下载STRING数据库中蛋白质相互作用网络 2. 下载Uniprot ID转换文件 打开...
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单细胞转录组分析R包seruat的版本比较
最近在用R学习单细胞转录组分析，让我比较头大的是seruat包，这个包的2.0+版本与3.0+版本差异真的很大。 参考视频是bilibili上‘生信技能树’的教学视频，用的是...
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DESeq2差异基因分析和批次效应移除差异基因鉴定 基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异，最简单的标准化方式是计算counts per million (CPM)，即原始reads count除以总reads...
