本文主要介绍一些生物小工具,尤其是在文章中的，还有就是生物信息学方面的，总而言之，言而总之，希望能够帮助到大家。 关键词：生物信息学工具;绘图工具 1、itol用于对系统进化...
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收藏贴-基因/蛋白功能注释、富集分析在线工具详解
Metascape网站（http://metascape.org ）是一个能对基因或蛋白质列表进行注释和富集等分析的在线工具，除了传统的GO注释和富集之外还提供的蛋白质互作分...
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R语言实现蛋白质相互作用网络——PPI可以用网页版做，但有上限2000个基因的限制。所以今天开发一下怎么用R飞一波。 1. 下载STRING数据库中蛋白质相互作用网络 2. 下载Uniprot ID转换文件 打开...
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单细胞转录组分析R包seruat的版本比较
最近在用R学习单细胞转录组分析，让我比较头大的是seruat包，这个包的2.0+版本与3.0+版本差异真的很大。 参考视频是bilibili上‘生信技能树’的教学视频，用的是...
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DESeq2差异基因分析和批次效应移除差异基因鉴定 基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异，最简单的标准化方式是计算counts per million (CPM)，即原始reads count除以总reads...
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单细胞预测Doublets软件包汇总|过渡态细胞是真的吗？
写在前面 Doublets ：一个液滴或一个微孔中包含了2个或多个细胞。 对于高通量方法，在细胞捕获效率和双重比例之间存在折中，通常的做法是以1-5％的双重线为目标（Zieg...
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WGCNA分析，简单全面的最新教程本文应该是第二全的WGCNA分析教程，参考了最新的文档。第一全的还在路上，会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上，欢迎点击链接了解更多。 WGC...
