细胞通讯分析可以给我们一些细胞类群之间相互调控/交流的信息,这种细胞之间的调控主要是通过受配体结合,传递信号来实现的。不同的分化、疾病过程,可能存在特异的细胞通讯关系,因此阐...
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常用的细胞通讯软件:CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]:是公开的人工校正的,储存受体、配体以及两种相互作用...
新的一周,新的开始,今天我们来分享一个cellphoneDB的升级版,CellphoneDB的V3.0版本,升级的最大改进在于服务于空间转录组的通讯分析,会结合空间位置和生态...
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什么是双聚类? 自从基因芯片技术产生以来,大量的生物数据需要分析,这些数据大多规格化之后以矩阵的形式表示和存储,俗称 DNA 微阵列矩阵或基因表达数据矩阵。一般的聚类是根据数...
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scRNA-seq整合简介 对两个或两个以上单细胞数据集的整合分析提出了独特的挑战。特别是,在标准工作流下,识别存在于多个数据集中的基因可能存在问题。Seurat v4 包括...