我生活在一线城市，每逢节假日或者需要用车的时候都是采用租车方式，对于买车，已经摇号了好几年，还没有摇到号，反正听天由命吧！能中再说。 长期的租车生活方式让我经常思考和...
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长期租车好还是买车好？ -
7. vegan包进行PCoA分析和可视化简介 PCoA分析，即主坐标分析（principal co-ordinates analysis），是一种非约束性的数据降维分析方法，可用来研究样本的相似性或差异性，与PCA...
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如何正确理解菌群alpha-beta多样性@(Dayueban)[肠道菌群|alpha多样性|beta多样性] 导读 很多时候我们往往拿着现成的数据就开始分析了（因为有师兄师姐的代码啊教程啊），或者干脆是公司测序和分...
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2021-06-18 两组间差异分析之t检验在R中实现来源：小白鱼的生统笔记 如有侵犯，立删做统计学分析的其中一个重要目的就是寻找组间差异，在研究中，我们最常关注的问题莫过于处理组与对照组是否存在了显著不同。就两组间比较而言，t...
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Adonis与ANOSIM检验究竟是什么？做微生物16S测序的时候，公司的报告里经常会给到两种检验Adonis和ANOSIM，听过t.test、wilicox、anova各种检验，那么Adonis和ANOSIM检验是...
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R: adonis进行permannovaadonis文档：https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics/adonis[htt...
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【vscode设置对应版本的R】最近蹭一波热度，重新开始用vscode写R。但是在配置过程中还是会遇到一些问题，遇到有意思的就记录下来。当通过Rpath修改/添加了R可执行文件，如下： 但还是发现无法设置成...
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绘制堆叠柱形图（ggplot 2）使用群落微生物物种丰度表数据
群落微生物物种丰度表-绘制堆叠柱形图（ggplot 2） 今天我们先来讲一下如何利用细菌群落的高通量测序数据来绘制堆叠柱形图来展示不同样品中优势菌的相对多度。 话不多说，直接...
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R语言创建空数据框(Empty Data Frame )用于追加数据
创建指定列数的空数据框 方法一 通过填充行再删除行生成空数据框 方法二 通过创建空矩阵转换成空数据框 方法三 通过填充初始化向量生成空数据框 通过向空数据框循环填充等长向量实...
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web scraper入门1.下载与安装 网页下载[https://crxdl.com/]网页下载 我的网盘分享(提取码n302)[https://pan.baidu.com/s/1F4KeEfmeR...
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R绘图：ggplot2绘制火山图火山图是测序分析报告中最为核心的图片之一。绘制火山图的方法有许多，Excel和第三方软件等，本文主要运用ggplot2和ggrepel两个R包演示[1][2]。横坐标为Fol...
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clusterProfiler包做GO分析1、加载需要的包 2、导入数据 我这里的数据其实就是一列基因名，是通过其它分析挑选出来的几百个基因，想要看看这些基因是否能够富集到某些特殊的通路3、ID转化做GO分析是不能直...
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科研狗，生物信息学
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从官网上下载TCGA数据不知从TCGA下了多少次数据了，每次都像失忆了一样重新研究……果然凡事都该动笔记下来 TAT本次以肝癌数据为例操作系统：MAC OS 1. 登陆TCGA网站 https://...
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CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url <https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda...
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