一、技术背景 蛋白质作为生命活动的重要分子之一,发挥着关键的作用。蛋白质的作用大多通过蛋白质之间的相互作用得以发挥,众多研究蛋白质互作的技术被开发出来。其中Co-IP全称Co...
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程,适用于初学者入门阅读,从原始测序数据开始,经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分析步骤,最终获得基因表达信息。...
前言:实验中往往比较关注某一信号通路基因的表达变化,而通过文献检索或利用转录组测序结果筛选,往往信息不全,缺乏系统性,如何提取出重点关注的信号通路上所有基因的序列,并进行下游...
在笔记1中,完成了GO和KEGG的enrich,后面的可视化其实非常简单。 1.气泡图~ dotplot(ego,font.size=5,showCategory=30) 2...
之前分享了如何用ggplot2可视化GO分析的结果。既然做了GO,当然少不了KEGG了。 1. 数据准备 同样的,我们从DAVID[%5Bhttps://david.ncif...
GOplot包介绍 GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说,该包将表达数据与功能分析的结果整合并进行可视化。但是要注意该包不能用于执行这些分析,只能把分析结果进行可视...