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单细胞数据标准分析Seurat流程： Seurat官网：https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...

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常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...

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1. 为什么我们要进行Normalization 测序深度：某些低表达量的基因只有在较高的测序深度时才能检测到。一般而言，随着测序深度的增加，基因种类以及可变剪接体的数目也会...

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R语言基础系列： R语言基础1--R数据格式：.rds和.rda的区别[https://www.jianshu.com/p/6a824548887b] R语言基础2--数据排...

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这篇综述今年6月1日发表在Journal of the American Society of Nephrology[IF=9.274]上。 在过去的5年里，单细胞方法使得能...

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AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集（如gene signature,gene module）的细胞。AUCell使用曲线下面积来计算输入基因集的一个关键子集是...

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基因表达趋势分析-1：TCseq[https://www.jianshu.com/p/b808085c7351] Mfuzz能够识别表达谱的潜在时间序列模式，并将相似模式的基...

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单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...

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在单细胞转录组解析肥厚性心肌病发病机制[https://www.jianshu.com/p/f270b9431427]里面看到计算某基因与其它基因的相关性 方法里写的是这样做...

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回顾一下：什么是单细胞转录组测序技术？ 细胞异质性是生物组织的普遍特征。由于传统的转录组测序(RNA-Seq)技术的测序水平是在个体或群体水平上对数万个细胞进行转录组测序，因...