R语言包的安装 参考文章 在R中大概有几种包的安装方式。 install.packages()常规包的安装 括号里面包的名称要加英文引号，在列出的CRAN镜像站点列表中选择一...
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R语言基础--包的操作与内置数据集 -
8. 群落结构差异显著性非参数置换的多变量方差分析(ANONIS)、相似性分析(ANOSIM)和多反应置换法(MRPP)常被用来评估不同采样点之间微生物群落组成差异的显著性。 一般来说，当我们通过降...
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匣子，女，现为大三学生，2015年得知朋友雷雷川藏线骑行归来后，萌生了骑行318的想法。采纳雷雷的建议，偶尔进行5千米长跑增强体质，无进行其他运动或练习。没接触过山地车的匣子，在距开始骑行前一个月买了山地车，跟着学校骑行社社员拉练了两次，2016年7月13日开始了为期28天的川藏线两千多公里的骑行之旅，全程没有搭车，没有寄过驮包，途中推车距离不超过两公里。以日记的形式记录了28天的318之行，用此文记录下对于作者来说很难忘的一段日子，期盼此文可为2017骑行川藏线的小伙伴提供参考，企盼此文鼓舞骑行小白们通过思量后勇敢踏上骑行之路！
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R语言基础之第二部分 操纵数据/取子集
R语言基础之第二部分：操纵数据取子集 2.1 构建子集[ ]：提取一个or多个类型相同的元素[[ ]]：从列表或数据框中提取元素$ ：按名字从列表or数据框中提取元素 2.1...
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利用ggpubr+ggplot2做barplot和boxplot图并显示显著性导读 以前总是借助PS来为新鲜出炉的R图添加统计显著标识，但是现在可以不用了，因为ggbubr可以一站式解决，而且画的图堪比SCI级别。话不多说，撸起袖子搞起来 工作流程 包...
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利用python自NCBI下载fasta和genbank文件
第一部分 自习室网络出奇的差，有时想打开NCBI网页下载文件时会一直在那里转圈圈，本来很简单的一件事有时却要浪费好长时间；恰好最近在学习 Bioinformatics wit...
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相关性分析及可视化R笔记近日，因宿舍小赵同学看文章，看到一张关于相关性分析结果可视化的图表，并对其表达含义表示了百思不得其解，于是在我们的男神428宿舍引发了一波生信小热潮。可能对于大佬们来说这是很...
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ggplot2高效实用指南简介 文章较长，点击直达我的博客，浏览效果更好。本文内容基本是来源于STHDA，这是一份十分详细的ggplot2使用指南，因此我将其翻译成中文，一是有助于我自己学习理解，另外...
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WGD（全基因组复制）分析——Ka/Ks及4Dtv值计算一、4Dtv（四倍简并位点颠换率）的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
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群体遗传 || 选择压力分析_基础知识个人博客原文地址 基本原理 [站外图片上传中...(image-38780a-1577372733833)]原始群体中，遗传多样性是十分高的，整个序列的核酸diversity...
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转录组学习二（数据下载）
转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究） 转录组学习五（reads的比对与samtoo...
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如何构建SNPs-based phylogenetic tree
如果根据SNP或者Indel 构建其系统进化树，可以展示群体中不同个体的相互关系，基因变异相似的往往会在同一个树的cluster中，一颗好的树可以给你一个群体大概的分类(你这...
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RNA-seq 数据分析最佳实战（综述）一篇RNA-seq分析流程的综述，全面而详细！深度好文，可用来反复阅读。初学者用于把握RNA-seq真个流程及各个流程选择上的差异。已经开始学习者可用来查缺补漏和发现新的分析...
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使用GEMMA进行复杂性状全基因组关联分析(GWAS)GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合线性模型的GWAS分析软件（文献信息...
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GWAS全基因组关联分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程，并提供了基本的命令，用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等，在此分享出来...
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