R语言包的安装 参考文章 在R中大概有几种包的安装方式。 install.packages()常规包的安装 括号里面包的名称要加英文引号，在列出的CRAN镜像站点列表中选择一...
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R语言基础--包的操作与内置数据集 -
8. 群落结构差异显著性非参数置换的多变量方差分析(ANONIS)、相似性分析(ANOSIM)和多反应置换法(MRPP)常被用来评估不同采样点之间微生物群落组成差异的显著性。 一般来说，当我们通过降...
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R语言基础之第二部分 操纵数据/取子集
R语言基础之第二部分：操纵数据取子集 2.1 构建子集[ ]：提取一个or多个类型相同的元素[[ ]]：从列表或数据框中提取元素$ ：按名字从列表or数据框中提取元素 2.1...
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利用ggpubr+ggplot2做barplot和boxplot图并显示显著性导读 以前总是借助PS来为新鲜出炉的R图添加统计显著标识，但是现在可以不用了，因为ggbubr可以一站式解决，而且画的图堪比SCI级别。话不多说，撸起袖子搞起来 工作流程 包...
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利用python自NCBI下载fasta和genbank文件
第一部分 自习室网络出奇的差，有时想打开NCBI网页下载文件时会一直在那里转圈圈，本来很简单的一件事有时却要浪费好长时间；恰好最近在学习 Bioinformatics wit...
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相关性分析及可视化R笔记近日，因宿舍小赵同学看文章，看到一张关于相关性分析结果可视化的图表，并对其表达含义表示了百思不得其解，于是在我们的男神428宿舍引发了一波生信小热潮。可能对于大佬们来说这是很...
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ggplot2高效实用指南简介 文章较长，点击直达我的博客，浏览效果更好。本文内容基本是来源于STHDA，这是一份十分详细的ggplot2使用指南，因此我将其翻译成中文，一是有助于我自己学习理解，另外...
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WGD（全基因组复制）分析——Ka/Ks及4Dtv值计算一、4Dtv（四倍简并位点颠换率）的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
