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GSEA相关笔记整理网页上关于GSEA富集分析的教程很多，对自己这个生信小白来说比较简单通俗易懂的当数生信宝典和生信技能树的教程了。感谢大佬们的付出。下面是自己整理的个人学习笔记，可能有理解不对...
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富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO前言 一般我们挑出一堆感兴趣的基因想临时看看它们的功能，需要做个富集分析。虽然公司买了最新版的数据库，如KEGG，但在集群跑下来嫌麻烦。这时网页在线或者本地化工具派上用场了。...
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读《T-Cell Differentiation》||免疫细胞の名门望族知道这本书是一个偶然的机会，那段时间正好在研究免疫细胞比较厉害的团队工作（忝列门墙啊），自然想找点资料来扩充一下自己的知识面，以便知道T细胞到底有几个正宗的亚群。如张老师对T...
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单细胞测序分析之Monocle2包学习笔记前一阵子练习了几个单细胞测序分析，然而对于所用的R包并没有深入的学习。作为强迫症晚期患者，想知其然，还想知其所以然，所以打算仔细的学习这些R包的使用。这篇文章将深入的学习Mo...
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monocle 2拟时序分析monocle做拟时序分析首先要构建CDS需要3个矩阵：expr.matrix、pd、fd，其次将Seurat中的对象转换为monocle识别的对象。然后选择想要做拟时序依据...
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monocle分析及结果解读1.写在前面的话： 近年来，由于细胞的异质性及发育分化等相关的问题越来越被研究者们所关注，单细胞转录组分析为研究异质细胞群的复杂生物学过程提供了方法和工具。每一个细胞进行转录...
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趁热打铁--scRNA cell-type specific responses在前面盲人摸象--single cell sequencing的Seurat学习--详细版这篇文章之后，我膨胀了！感觉好想好想学习，因此，依据之前阅读单细胞文献的经历，将自己...
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R使用笔记: scatterplot with confidence ellipses;envfit的实现及释意笔记内容：用ggplot2绘制scatterplot with confidence ellipsesenvfit的R实现及释意用ggpubr绘制scatterplot wi...
