一、Metascape简介 Metascape（http://metascape.org/[http://metascape.org/]） 是一个功能强大的基因功能注释分析工...
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Metascape 专门为生物学者设计的基因富集分析网站
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重组质粒的构建（含引物设计）本文以白细胞介素6为例，介绍基因工程重组质粒构建的一般步骤。 1.准备 本文使用到的两个软件为Vector-NTI-Advance和snapgene： Vector-NTI-...
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SMART单细胞RNAseq测序原理陈魏学基因系列-单细胞RNAseq测序原理 视频 总结 该方法有两个特点：特殊的引物设计，采用MMLV作为逆转录酶 引物设计 引物设计的第二、三、四部分目的是：使引物正好结合...
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RPKM、FPKM、TPM详解
简写 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千个碱基的转录每百万映射读取的rea...
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Ribo-seq实验总结
Ribosome profiling是一种新出现的实验技术，它结合了高通量测序技术的应用，可以在全基因组水平上监测蛋白质的翻译水平，给研究细胞内蛋白质的翻译调控机制带来了新的...
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关于Title：标题大小写
（注：本文内容改编自LetPub） 标题有两种基本样式。 1.“title case”，即标题样式：标题第一个、最后一个及所有主要单词的首字母大写。 例如：Biochemic...
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TCGA / 癌症简称 / 缩写 / TCGA癌症中英文对照
TCGA数据库中含有的癌症名称，简写和中文名称 Abbr英文名称中文名称ACCAdrenocortical carcinoma肾上腺皮质癌BLCABladder Urothe...
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下载TCGA基因表达量文件，应该选Count,FPKM还是FPKM-UQ ?GDC中转录组的表达量文件有3种类型，分别对应着不同的定量方法。 Counts 就不用说了，来看看FPKM和FPKM-UQ有啥差别，这个可以查看GDC的官方说明文档中的转录组...
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TCGA|GEO可视化分析第1篇---相关性分析导读：今天有小伙伴问我，筛选完差异基因后，想看自己关注的基因和其他基因的关系，应该怎么做？那当然要先做一下相关性分析了！好，下面让我给大家娓娓道来...... 正文： ste...
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GDC Data Transfer Tool 下载TCGA数据一、GDC Data Transfer Tool下载 GDC Data Transfer Tool是TCGA官方基于python开发的下载程序，在TCGA官网GDC部分可以找...
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TCGA学习03：生存分析TCGA学习01：数据下载与整理 - 简书 [https://www.jianshu.com/p/79816a20cbb1]TCGA学习02：差异分析 - 简书 [htt...
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关于TCGA（癌症基因组数据集）使用指南The cancer genome atlas(TCGA)数据库储存20多种癌症的基因组数据，作为生信喵少不了要下载上面的数据来分析。写篇文章介绍一下，也加深自己的印象。 T...
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siRNA干扰实验流程
前言 在研究某基因的功能时，常常要用到某基因的过表达，或敲除，或敲低。 在敲除方面，常用的就是Crispir/Cas9技术，不过此技术周期比较长，步骤比较麻烦，就我们实验室而...
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经验总结：细胞转染那些事儿
细胞转染对初接触细胞实验的科研人员而言，是一道难过的坎儿，细胞转染率低的话，你珍贵的细胞可能就只能扔掉了。 大家都知道，细胞是由带负电荷的磷脂双分子层构成，这对大分子物质来说...
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