发简信
IP属地：北京
-
将数据集中一个CELL拆成多行或反过来
一、将一个CELL的一行转成多行 在做数据清洗时，有时会遇到一个cell中是很多个逗号隔开的数据，也就是一对多的情况，而我们需要将其转为每一行是...
-
用topGO进行GO富集分析topGO是一个半自动的GO富集包，该包的主要优势是集中了好几种统计检验的方法，目前支持的统计方法如下： 一、安装 BiocManager::i...
-
用blast进行本地化搜索PHI数据库
PHI（pathogen host interactions）是一个病原菌和宿主互作的数据库，包含了许多已报道的病原菌致病相关基因的信息。网页版...
-
转录组差异表达基因分析基本流程（上）
入门而已，主要是为了熟悉转录组分析的基本流程，得到差异表达基因，所以在数据上选择了比较小的单端测序数据，同时也不考虑论文出处，仅简单分析数据。数...
-
GO富集分析GO富集是组学数据分析常用的手段，通常用来挖掘差异基因中GO term的富集程度。Fisher's exact test是常用的统计检验方法，但...
-
GO文件中的注释信息是如何得到的
一直很好奇GO注释文件中的信息是如何得到的，终于在《The Gene Ontology Handbook》中找到了答案。GO的原始文件可以分为两...
-
基因本体论一、什么是生物学功能 根据Paul D. Thomas的说法，现在关于什么是生物学功能的讨论主要有两种："causal role functio...
-
本体论是什么
Dispite this popularity and widespread use, many aspects of the Gene Ont...
-
Phylogenetic tree——系统发育树的构建具体构建发育树的软件非常多，这里主要使用R软件中的tidytree, treeio和ggtree包来进行数据整合、操作和图像绘制(https:y...