12年有篇BMC的文献对几款预测的软件做了评估,其实参考大多数的文献中最常见的俩个软件也就是Prodigal和Metagenemark这俩个软件,分析过程中我这俩个软件都感受...
前言 使用 pheatmap 已经能够绘制满足大多数要求的聚类热图了。 受 pheatmap 包的启发,ComplexHeatmap 提供了对热图更多更灵活的控制,如多数据热...
请问楼主 silva.16s_bacteria.tax 这个文件从哪里获取
微生物多样性qiime2分析流程(4) 训练特征分类器进行16s数据注释经过前面的分析步骤,我们得到了特征表,代表序列及进化树文件,并更改了其名称;接下来就让我们根据silva 138数据库训练特征分类器来对代表序列进行注释: 1.导入参考序列数...
原文地址:https://mp.weixin.qq.com/s/xg7cggq45tBI0EQUSxPKFw 8.1 Introduction 第八章讲的是ggplot2的主...
其实不论是PCoA还是PCA图均是用散点图来展示结果PCoA和PCA的结果,PCoA和PCA准确来讲是数据降维分析方法。顺便值此佳节,祝福各位和“科研”都能够拥有幸福时光和美...