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Python常用基础语法知识点大全记得我是数学系的，大二时候因为参加数学建模，学习Python爬虫，去图书馆借了一本Python基础书，不厚，因为有matlab和C语言基础，这本书一个星期看完了，学完后感觉P...
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生信软件安装神器 Mamba [conda加速器~]简介[#toc_0] Mamba是在c++中对conda的重新实现,可以认为是更高级的conda。有以下特点使用多线程并行下载数据和package，实现更高效的安装libso...
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我也没有解决，你们呢？？？
使用liftover创建注释Chain文件（基因组坐标转换）
问题情形： 在自己组装出一个基因组之后，会想要看自己的序列的组装情况和染色体朝向，或者是想根据已有的基因组注释文件创建自己的基因组的注释文件。这个时候需要的是一个chain ...
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跨物种同源基因转换（biomaRt和homologene）2022-06-17
适用背景 当我们进行跨物种比较分析时会发现基因名对不上，或者找不到基因，这时候就需要进行物种间的同源基因转换。最常用的工具就是Ensembl的biomaRt，另外还查到NCB...
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快速实现人和小鼠之间的同源基因转换
我们知道小鼠是一个研究很多的模式生物，有很多生物学研究，以及一些临床研究都是在小鼠上做的。那么小鼠里面研究的这个基因在人里面有没有，对应的具体又是一个什么基因，这是我们经常需...
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遗传学 博士研究生在读
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对peak进行功能注释的GREATGREAT是一款peak区间进行基因注释的工具，除了给出peak对应的基因外，还集成了多种基因的功能分析，网址如下 http://great.stanford.edu/pub...
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Hi-C分析练习（从fastq文件到contact矩阵）最近纽约复工，因为每天要做实验（还得全程戴口罩，非常闷得慌），比不了之前每天都在家可以为所欲为的自学生信，所以更新也少了很多~ Hi-C的技术相关背景学习笔记我在之前有写过（...
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Hi-C文库数据质控及解读
来源： 三维基因组Magic [三维基因组Magic](javascript:void(0);) 2017-11-29 Hi-C文库数据质控及解读 数据自身的质量在很大程度上...
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HZAU植科院农学本科毕业生<br>HZAU信息学院生信专业硕士毕业生<br>目前就职于国内某知名药企数据分析岗位<br>主要擅长SAS,R,Python,Linux,Shell,Power BI,Power automatic<br>对爬虫、网站搭建感兴趣<br><br>欢迎一起讨论呀~<br>简书不定时查看，有需要欢迎知乎私信:<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.zhihu.com%2Fpeople%2Fcao-kai-30-84" target="_blank">https://www.zhihu.com/people/cao-kai-30-84</a>
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HiC数据分析之-HiC-Pro软件安装： 主要是编辑系统文件： PREFIX =/gpfs02/home/jingjing/software/HiC-Pro-master BOWTIE2_PATH =/g...
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【三维基因组】Hi-C call loops？-choose juicer ! 之 step1Juicer Tools 简介以及前期处理 Juicer 软件分析流程以及几大模块,如下图所示： JUICER主要分为三个模块 JUICER Tools，JUICEBOX，S...
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GenomicRanges 数据结构
R 包 GenomicRanges 是 Bioconductor 项目承载基因组位置信息的基础包，为诸如 BSgenome,rtracklayer,VariantAnnota...
