富集分析 早期的基因列表解释依赖于选择一系列高得分的基因,然后建立相当主观奇怪的关系。富集分析是一个自动的,基于严格的统计学的方法来分析和解释很大的基因列表,使用的是先验知识...
代谢组学是近年发展快速的一门学科,目前在医学、植物学、微生物学、毒理学、药物研发等多个领域中得到了广泛的应用。如何从复杂的代谢组学数据中提取出有价值的信息,筛选出潜在的生物标...
A Comprehensive Proteomic and Phosphoproteomic Analysis of Retinal Pigment Epithelium R...
我们可以利用KEGG数据库中的KEGGMapper工具查询多个基因信号通路。根据基因表达差异列表,利用KEGGMapper进行转换。示意图如下。 首先,我们将需要查询的基因名...
CCLE是肿瘤细胞基因表达的百科全书,之前写CCLE:求任意基因的相关性[https://www.jianshu.com/p/59f979ab09ee]稍微介绍过其用法。今天...
写在前面 简单来说,hub基因就是网络中节点连接的瓶颈基因,一个连接了很多节点的基因。这篇文章仍然来自几篇文章及自己平时的积累,主要阐述关键基因和hub基因。很多人误以为hu...
表达量差异分析 经过搜库鉴定和波峰分析,可获得同一蛋白在不同样本中的表达丰度。再对多样本(≥ 2)项目进行样本间蛋白的差异表达分析,挖掘和筛选出样本间差异表达蛋白,并进一步分...
多组学分析是指两个及以上组学,同时做数据分析。通常是同一批样本的多组学分析,常见有基因组、外显子、转录组(含非编码)、蛋白组、磷酸化组、代谢组等,也包含各类修饰组学,如DNA...