发简信
IP属地：青海
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这个世界流行离开，但我们却不擅长告别
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@Bio_Infor 您好！今天才看到您的推文，正在学习单细胞，请问能够分享复现的全部流程吗？我想学习一下
单细胞分析踩坑实录：DotPlot()之'RNA' assay还是 'integrated' assay?
前段时间在生信技能树单细胞学习小分队分享单细胞文章复现，一不小心就踩了一个坑……记录在这儿和大家一起分享。 背景 主要是想复现2020年发表在 PNAS 上的一篇题为 Sin...
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南京大学生物学，佛系更新~
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北京中医药大学博士，一个会科研的中医大夫
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请问，SCTtransform 预处理默认是选取3000基因，做基因可视化时如果基因不在这3000个基因中，是不是还是得用RNA assay呢？
sctransform预处理后，如何进行差异表达分析
一、seurat执行差异表达分析 根据单细胞数据预处理的方式不同（lognormalize和sctransform），执行差异表达分析代码有所不同，这个需要注意。我当时请教过...
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青山卷白云，留酌待情人
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公众号：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2读研，学习方向：癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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努力努力再努力~<br>个人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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喜欢写代码的外科医生。
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珠江医院肿瘤科简书号，同时也欢迎大家关注我们的微信号！
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不看私信<br>看不到的文章是被简书锁了
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你好，请问想要看基因在各细胞系的表达需要下载哪个数据?read.count数据吗？
CCLE：求任意基因的相关性
进行肿瘤的研究，求两个或多个基因的相关性，可以用GEPIA2或者直接下载数据用R语言处理，如果能再加上细胞系的相关性就能完美了。下面就分享下，手动下载CCLE测序数据，求任意...
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好记性不如烂笔头，温故而知新。踏实一些，不要着急，你想要的岁月都会给你！
