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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
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欢迎大家分享自己在完成生信技能树linux作业时的笔记心得 。 生信人的 linux 20题 <http://www.bio-info-trainee.com/2900.html 处理 fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF等**格式（约定成俗，大牛推广）**的数据 fasta和fastq格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3575.html sam和bam格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3578.html VCF格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3577.html
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scRNA-Seq | Seurat 打通单细胞常规流程Seurat standard pipeline(10核心流程) 创建Seurat对象 Read10X CreateSeuratObjecet质控 PercentageFea...
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写一封信 | 给踏入大学的小朋友
展信安，万万没想到，我还是选择带一个本科生班级（都柏林学院22园艺1班）。知道我的，或许都清楚，其实我并不喜欢别人喊我「老师」云云。与我而言，叫一声「老师」和一声「师兄」，是...
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【DL笔记2】神经网络编程原则&Logistic Regression的算法解析本文是【专题“DeepLearning学习笔记”】的第【2】篇上一篇：【DL笔记1】Logistic回归：最基本的神经网络 一、神经网络中的编程指导原则 就一句话： 只要阔能...
