生物数据库 基本序列格式 1.FASTA格式：首行为描述行，以>为起始，其后为描述信息；第二行即为原始序列。2.FASTQ格式:FASTQ格式包括四部分信息：第一行为包含序列...
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ChIP-seq基础入门理解ChIP-Seq 到了目前这个水平，我学习新的高通量数据分析流程时已经不再考虑代码应该如何写的问题了。我更多要去考虑一个技术的目的和意义。 转录组主要研究的问题是基因在不...
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表观遗传学-组蛋白修饰一、染色体简介 DNA Packing 1、如何将10,000公里长的蚕丝(半径~10e-5米)装入一个篮球中。2、蚕丝的体积：3.14*10e-3 m33、折叠、缠绕......
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表达谱分析组织中细胞组分情况 --- CIBERSORT & xCell肿瘤微环境是近年来的研究热点。复杂而动态的微环境中，肿瘤细胞与浸润性免疫细胞、基质细胞等相互作用，这在促进或抑制肿瘤生长、侵袭、转移以及对病人临床预后方面可能具有多方面的影响...
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Cre-LoxP条件性基因编辑系统--学习笔记背景 Cre/LoxP系统来源于F1噬菌体，是非常经典有效的基因编辑技术。 1. 什么是Cre Cre重组酶(cyclizationrecombination)，它是一种由3...
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欢迎大家来到我们的生信星球第五十期训练营～“公众号：生信星球” 在这里，希望你能收获知识和快乐，结识一帮志同道合的小伙伴 豆豆和花花也会尽力帮助大
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「r<-包」UCSCXenaTools: Retrieve Gene Expression and Clinical Information from UCSC Xena for Surviva...The UCSC Xena platform provides an unprecedented resource for public omics data from bi...
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11 生存模型的C-index
现阶段用的最多的是肿瘤患者预后模型的预测精度。 C-index，C指数即一致性指数（index of concordance），用来评价模型的预测能力。c指数是资料所有病人对...
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【r<-ROC|包】分析与可视化ROC——plotROC、pROC在【r<-绘图|ROC】ROC的计算与绘制这篇文章中我讲了ROC曲线的本质以及如何计算和绘制ROC曲线。注意，我这里谈到的ROC并未曾涉及机器学习模型的拟合与预测，而是指存在...
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收录各种Bioconductor资源、译文、学习笔记，介绍。欢迎大家来稿，一起建立简书的bioconductor专题。
