所有的学习都是从模仿开始的,所以我又开始跟着小洁老师继续学习了。知识是日积月累的,希望自己走的每一步都是扎实的。 1.下载包及引用数据 让我们看...
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首先感谢生信技能树大神jmzeng1314提供的github包,由于我这边访问github比较困难,因此我已经导入到我的 gitee 托管平台...
导读 个人笔记,初次分析芯片数据,纯属练习,不涉及生物学意义。 一、数据获取 1 GEO官网中输入GSE编号,检索 2 获取分组信息,下载丰度表...
简介:风险因子关联图常见于cox风险比例模型,常见于下图这种三图联合的展示形式,展示的是由cox风险模型区分出的高风险和低风险人群在人群比例、生...
通常情况下,通过以下几种指标来对模型进行评价。1)区分度:采用指标C-index和ROC曲线来评价区分度,一般文章都是二选一。 C-index即...
DCA曲线简介 DCA是一种评估临床预测模型、诊断试验和分子标记物的简单方法。传统的诊断试验指标如:敏感性,特异性和ROC曲线下面积仅测量预测模...
获得平台探针注释信息 这个probe矩阵里就有详细的探针信息啦~其中第15行是gene_symbol,接下来会用到 获取表达谱数据和表型矩阵 这...
一个上午搞定了,难搞的表达矩阵中提取随机样本。 数据包简介: 首先,GSE63885共有100多例病人样本,而我选择的是随机的29例(指定)。如...
01—研究背景 多因素cox回归分析方法是英国统计学家 D.R.Cox 于 1972 年提出的比例风险回归模型 (proportional ha...
文章来源:生信技能树原文:GEO数据挖掘-第三期-口腔鳞状细胞癌(OSCC)文章标题 A pplication of weighted gene...
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