发简信
IP属地：山西
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比对结果有缺失，RSEM不能定量
bowtie2比对: Index索引构建(hg38, rRNA, mito, spike in)
常见的序列比对工具有很多，如blast、hisat2、bowtie2、bwa、STAR等。每个工具都有其自身的优点，但同时也具备了一些缺点。 bowtie适合长度在50b长度...
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RNA-seq数据的上游处理及工具HISAT2; STAR; RSEM; featureCounts; Htseq-count; kallisto; salmon
欢迎批评指正 一、上游处理流程 上游处理步骤包括质量检测、质量控制、比对、定量[2]，每一步处理数据的目的都是不同，也有相关的软件与之对应。通过质量检测，原始数据的各种问题将...
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中科院硕博生一枚，用简书来记录自己精读paper和学习生信的过程。
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生而孤独 活而精彩
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一条小咸鱼
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最近不常登陆简书，若评论问题没有及时回复，可以发邮件交流 bioinfortime@163.com
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毕业于山东大学，具有6年生物信息分析工作经验，一直从事动植物及人的重测序方向。擅长群体重测序及GWAS分析；进行过NIPT，CNV，肿瘤ctDNA，遗传肿瘤等人类健康方向相关的分析；使用linux，perl，R，git等
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蛋白质工程
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微信公众号番茄随笔
