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宏基因组之基因丰度计算目前有两种方式可计算宏基因组基因的丰度，一种是基于比对，比如bwa,bowtie,soapaligner等主流的比对软件，另一种是不比对快速估计基因丰度，可以用近俩年来流行的...
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BioAider V1.423新版来袭 + 基因突变棒棒糖图转眼又临近毕业季，离别是总会到来的，但也可以选择留下点什么，如题。 考虑到大家都非常忙，有的甚至还在熬夜写基金，为此我也长话短说。 对于做序列分析的同学来说，每年这个时候总是...
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MicrobiomeAnalyst：一款基于网页的分析工具
该款软件具体操作已发布《Nature Protocol》上，获取原文：点击此处获取 1. 研究微生物菌群常用的方法有三种： 1）Marker基因调研，以获得整体群落结构； 2...
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北京基因组所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最优，搜索全局最优
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RNA-seq中的那些统计学问题（二）FPKM/RPKM之外的那些标准化方法目录 1. 标准化1.1. House-keeping gene(s)1.2. spike-in1.3. CPM1.4. TCS1.5. Quantile1.6. Media...
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几种标准化方法的学习笔记不管在RNA-seq还是ChIP-seq分析中，都涉及到一个概念，就是标准化。作为一个刚入门的小白，总是听王院长和其他熟悉生信分析的同学们强调标准化的重要性。 为什么说它重要...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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jModelTest的使用以下内容来自于对jmodeltest官方操作手册的总结和自己的实操经验 jModelTest 是用来计算最优核苷酸替代模型，依据5种不同的模型选择策略，包括最常见的AIC和B...
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一条小咸鱼
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一条小咸鱼
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基于Vcf文件进行基因单倍型分析单倍型，是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的简称，在遗传学上是指...
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学习笔记<br>研究方向: 植物群体遗传学<br>
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