这个步骤推荐在R里面做,载入表达矩阵,然后设置好分组信息,统一用DEseq2进行差异分析,当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。基本任务是得到差异分析结果,进...
纯genome的hisat2 index是指没有用--ss和--exon?
充钱也不一定变强,腾讯云服务器建小麦基因组index写在前面 求爷爷告奶奶的在服务器上跑了几次hisat2目录,还是因为小麦基因组太大无法成功。最后只能去了外显子和可变剪切建立index。终归是不死心,虽然唐医生表示可以借我一...
author: "余顺太"date: "2020-03-23" 主要参考的生信技能树文章:原创10000+生信教程大神给你的RNA实战视频演练 上游流程一般不用学,公司测好序...
有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里...
wget http://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/vertebrategenomics/exonerate/exonerate-2.2.0-x86...
这是我第一次写简书上面的文章,为什么这一次提笔想记录一下整个下午自己遇见问题,解决问题的过程,以前都是自己解决完问题记录在有道云笔记上就OK了,今天感觉像这样的过程在以往的科...