放一张效果图，这些，三四年前的东西，我其实一直懒得说。 写在前面 “Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说，也是一时兴起写出来的。开发的...
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TBtools | 多图合一至强版教程！进化树 + Motifs + 结构域 + 启动子 + 基因结构 + .... -
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基因组基因复制的分类鉴定：DupGen-finder
参考：https://www.jianshu.com/p/0a14d971bd0a[https://www.jianshu.com/p/0a14d971bd0a] requi...
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使用WGD鉴定全基因组复制
转载自链接：https://www.jianshu.com/p/3cfeb49c821a[https://www.jianshu.com/p/3cfeb49c821a] 古老...
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使用wgd进行全基因组复制分析这篇教程是我在2019年9月左右分析WGD时的笔记。目前来看，背景介绍和软件使用说明都基本没啥问题。但是现在更建议大家使用wgdi进行比较基因组学中相关分析，教程见如何用WG...
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R进行多序列比对及绘制进化树多序列比对Multiple sequence alignment（MSA，多序列比对）[https://zhuanlan.zhihu.com/p/671936310]大家一定...
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不出Rstudio, 实现从多序列比对到画进化树本文是对前几天的打脸打脸之处就在于发现了muscle的R包，从此不用再为序列比对东奔西跑—— Step 1. 从基因名拿到序列 这一步用到的包：biomaRt ，选择用sym...
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相同问题，解决了吗？
为什么orthofinder结果文件MultipleSequenceAlignments里面没有SpeciesTreeAlignment.fa这个文件
这是我的运行命令 重复了两三次了 还是没有 求救~
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你好，请问里面用到的脚本是哪个软件里的，像singlecopy2tree.bash， getLongProteins.py， checkFa.py这样的脚本
Orthofinder2鉴定单拷贝基因并构建进化树
实验目的：比较基因组学，从基因组获取单拷贝基因，并构建有根的进化树，并估计分化时间，最终画出有分化时间的进化树实验流程：orthofinder2获取单拷贝基因——muscle...
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Where PyTorch begins
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2020年的3+分ceRNA分析长啥样？
大家好，今天小编和大家分享的是1月份发表在Frontiers in Genetics(IF：3.517)杂志上的一篇文章，“Dysregulated lncRNA-miRNA...
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LncACTdb 2.0：疾病相关的ceRNA网络数据库 | 数据库推荐
作为中心法则的关键分子，RNA家族一直是研究热点，microRNAs (miRNA)、长链非编码RNA（lncRNA）、环状RNA（circRNA）....以及竞争性内源性R...
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环状RNA分析下游看了一圈，好像没有环状RNA分析的下游 CircRNAprofiler 是一个基于 R 的框架，只需要 R 安装，并提供15个模块，用于对 circRNA 进行全面的计算机分...
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小RNA分析软件
小RNA分析软件 新miRNA预测 mireap mirdeep2 miRDeep-P/miRDP miRDP2 miR-PREFeR ShortStack miRNA靶基因...
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Risearch分析RNA与RNA之间的互作关系
Risearch分析RNA与RNA之间的互作关系 预测lncRNA和circRNA的靶基因，需要参考RNA与RNA之间的互作结果。在线平台的RNA与RNA之间的互作关系预测也...
