小RNA分析软件 新miRNA预测 mireap mirdeep2 miRDeep-P/miRDP miRDP2 miR-PREFeR Shor...
分析内容如下图所示: 具体分析步骤如下: 数据质控,使用 kneaddata 软件, 该软件先调用 Trimmomatic 过滤数据,然后利用 ...
PICRUSt2 PICRUSt2 (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstr...
KEGG pathway 注释整理 获得KEGG注释 通过eggnog-mapper和interproscan两个软件(或数据库),可以获得KE...
构建非冗余rRNA数据库 参考riboPicker官网文档。 下载并安装riboPicker 主要为了使用该软件自带的格式化脚本; 自带的bwa...
生物信息分析常用文件格式和软件 文件格式 数据格式 fastq fasta 注释 gtf gff bed bcf 比对格式 sam bam 工具...
如果要使用conda安装生物信息学软件,就需要设置bioconda软件源。下面是官方给出的设置方法: 在国内建议使用中科大的源,设置命令如下, ...
首先得到每条序列的长度,在这里使用seqkit软件。seqkit软件是一个强大的序列处理工具,安装方法参见官方网站.代码如下: 结果如下所示: ...
STAMP软件安装 软件官网http://kiwi.cs.dal.ca/Software/STAMP 1. Microsoft Windows系...