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你好，请问一下，在上传文件后面的那个箭头框勾选和不勾选有什么区别嘛，我不是很懂哎
IRscope:可视化叶绿体基因组四个区连接位点
更新 2020年6月18号 这个在线工具可能是因为网速的的原因吧非常不好用，我录制了一期视频介绍了一下如何本地使用这个程序https://www.bilibili.com/v...
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叶绿体基因组注释软件PGA-Plastid Genome Annotator叶绿体是绿色植物细胞中进行光合作用的细胞器，是世界上成本最低、创造物质财富最多的生物工厂。叶绿体基因组主要编码与光合作用密切相关的蛋白质，作为细胞内半自主性的细胞器，...
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mVISTA格式文件：由Perl脚本处理GenBank注释文件而来
Bioinformatic_Scripts/get_mVISTA_format_from_GenBank_annotation 1、简要说明 mVISTA是常用的叶绿体基因组...
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读文章重复结果：使用DnaSp软件计算核苷酸多态性Pi(nucleotide diversity)
叶绿体基因组的文章中通常会有一小部分内容是运用DnaSp软件来进行核苷酸多态性π分析，断断续续看了也好长时间了，今天终于重复出了结果，简单记录自己的重复过程： 论文：comp...
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
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2017年12月12日～2018年1月21日学到的软件和方法的总结Bioinformatics Blast 我在Linux Mint中进行数据分析，使用linuxbrew和conda安装生物软件，用brew install blast和co...
