课程笔记施工中。。。。。 1.SCENIC简介 目前单细胞转录组领域用的比较多的细胞聚类方法大多是直接从基因表达矩阵推断，但是对于多样本合并分析，很多情况下会出现难以解决的批...
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单细胞转录组之转录调控网络分析 -
如何给Seurat对象的基因重命名？【基因名转换】2022-07-27
适用背景 在单细胞分析中，必要的一步是对每个细胞进行注释，这相当于给每个细胞打个标签，或者说起个别名，这些信息都存在@meta.data信息里，所以不用特意去更改细胞名字，S...
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一文总结：双荧光素酶实验的原理、应用及详细步骤想验证miRNA与靶基因的作用? ——双萤光素酶报告基因检测 想了解miRNA和lncRNA/circRNA的靶向互作?——双萤光素酶报告基因检测 想知道转录因子对下游基因的...
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R语言 | forestplot包绘制森林图
原文：R语言 | forestplot包绘制森林图在Meta分析中森林图比较常见，但其实掌握了用R语言中的forestplot包绘制森林图的各个用法，森林图可以用于表示其他数...
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肿瘤突变分析神器-maftools包得益于曾老师的介绍引导，了解此包。了解一个包，先看包的说明书，包的用法都在里面。maftools包说明书 1.安装包，加载包 source("http://bioconduc...
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TCGA数据的一致性聚类实战和可视化通过不同的聚类算法，依据不同的基因或指标给样本聚类，是数据挖掘文章里面经常出现的操作咯。接下来要写写不同聚类方法的介绍和代码实现啦。 1.输入数据 目前从网上找到的代码大多是...
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公众号：误入BioInfor的大黄鸭
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TCGA Cox模型-训练集、内部验证集、外部验证集综合构建Cox风险模型①
2021.11.12 初版2021.11.16 更新单因素COX输出结果，多了半边括号...本系列主要用于通过使用训练集（train）、内部验证集（test1组）、外部验证集...
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零基础学生信入门笔记(R语言、Linux、Python、RNA-seq、单细胞测序、质谱流式、TCGA、GEO、单细胞经典文献解读)
医学生零基础学生信是先学Python还是先学R语言？[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何学习R语言[https://www...
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孟德尔随机化之基础概念与研究框架
在本期中，我将说明孟德尔随机化的基础概念与研究框架，并解释如何使用孟德尔随机化去解决常规流行病学问题。 2.1什么是孟德尔随机化？ 孟德尔随机化是在非实验数据中使用遗传变异来...
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GWAS全基因组关联分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程，并提供了基本的命令，用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等，在此分享出来...
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一、Linux系统与shell环境准备Linux简介 组成部分image.png 内核image.png Linux与windows的区别image.png 目录结构image.png shell简介 与linu...
