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你好，非模式植物footprint用啥鉴定呢
生信 | ATAC-Seq基础分析+高级分析+多组学分析
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了，相关脚本、教程也很多，但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间，但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识，不断记录反思，也...
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ChIP 差异peak 脚本（DESeq2&DiffBind）
ChIP-seq-analysisIn-depth-NGS-Data-Analysis-Course 以下使用DESeq2 & DiffBind R 包，来分析差异的peak...
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“如果引物（barcoded_primers.fasta）只有两个的话，不要用isoseq。它正是用来去除三个引物时造成的假阳性信号” 请问这里指的是primer只有两条的话，lima里面不用参数--iso-seq吗？
把HiFi reads变成转录本文件
这一次是主线任务，不过要简单许多。官方帮助：IsoSeq/isoseq-clustering.md at master · PacificBiosciences/IsoSeq...
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想请问下，subreads,bam文件大小为71G，转为ccs.bam就521M了，这是正常现象吗
pacbio 三代全长转录组数据分析流程
Iso-seq基础概念，转载自https://blog.csdn.net/weixin_34384681/article/details/85937505[https://b...
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GENIE3预测基因调控网络前言 今天来讨论下利用Tree-Based的方法来建立基因之间的调控关系，最近看到一篇17年发表在Nature Methods的文章《SCENIC: single-cell ...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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【不定期更新】Bedtools大全--42个子命令介绍参考链接： 用法大全: 官方说明：https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/overview.htmlBedtool...
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HZAU植科院农学本科毕业生<br>HZAU信息学院生信专业硕士毕业生<br>目前就职于国内某知名药企数据分析岗位<br>主要擅长SAS,R,Python,Linux,Shell,Power BI,Power automatic<br>对爬虫、网站搭建感兴趣<br><br>欢迎一起讨论呀~<br>简书不定时查看，有需要欢迎知乎私信:<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.zhihu.com%2Fpeople%2Fcao-kai-30-84" target="_blank">https://www.zhihu.com/people/cao-kai-30-84</a>
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但pheatmap是真的简单
使用ComplexHeatmap包绘制复杂热图（pheatmap真不香）
之前绘制热图主要使用pheatmap，开始觉得这个包又简单又美观，但用多了以后自己对热图要求高了，发现这个包不是太灵活，很多细节没有提供参数来调整，一些需求需要自己调用底层的...
