大家好,好久不见,现在纯做转录组想发个文章已经越来越卷了,而且好多期刊已经明确规定了要加实验,对临床gou特别不友好。那么有没有不用做实验还可以发高分的文章呢?答案很明确,是...
感谢 你的解答 太棒了
SCENIC feather文件下载记录最近在学习SCENIC来分析单细胞转录因子活性。在下载这步就卡住了。教程里需要下载好所需的feather文件 根据教程在RStudio中运行,然后再运行如下代码进行下载:ge...
最近在学习SCENIC来分析单细胞转录因子活性。在下载这步就卡住了。教程里需要下载好所需的feather文件 根据教程在RStudio中运行,然后再运行如下代码进行下载:ge...
scVelo于2020年发表在Nature Biotechnology[https://www.nature.com/articles/s41587-020-0591-3],...
ZDOCK简介 ZDOCK一种基于快速傅里叶变换的刚性蛋白对接程序,由University of Massachusetts Medical School创建。ZDOCK会搜...
ICGC数据下载和整理 1.数据下载 https://dcc.icgc.org/[https://dcc.icgc.org/] https://dcc.icgc.org/re...
书接上文,对于普通使用者来说,使用PyMOL是为了更好的将预测的蛋白质三维结构模型呈现出来。本期将从蛋白质三维结构预测开始演示如何使用PyMOL呈现三维结构,做出自己满...
影响因子:8.786 关于非肿瘤生信,我们也解读过很多,主要有以下类型 1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基因。2 单个疾病结合免疫浸润,铁死亡,自噬等基因集,机器...
当比较不同细胞的基因表达时,特定基因的read数被用作表达的代理指标。然而,这一指标会受到技术差异的影响,比如样本之间的测序深度差异,或者部分样本中未被检测到的表达基因。因此...
分享的文章质量很高 @长岛冰茶子
最新13+基因集泛癌分析,投稿也需要勇气!影响因子:13.751 关于基因集泛癌分析的文章,我们最近也解读过很多 目前我们有一些基因集/通路的预分析结果,可进行深入分析,也可以提供你感兴趣的基因集,我们来做分析。 研...
影响因子:8.44 本文的思路是通过单细胞数据分析识别了某种免疫细胞特有的marker基因,然后利用这些基因进行预后模型的构建。事实上,预后模型的文章已经不好发了,甚至有的审...
大家好,今天要和大家分享的是2021年4月发表的一篇文章:“Pan-Cancer Analysis Reveals Distinct Metabolic Reprogramm...
大家好,今天要和大家分享的是2021年11月发表的一篇文章:“Hiding in the dark: pan-cancer characterization of expre...
影响因子:13.751 关于基因集泛癌分析的文章,我们最近也解读过很多 目前我们有一些基因集/通路的预分析结果,可进行深入分析,也可以提供你感兴趣的基因集,我们来做分析。 研...
1.需求 为了直观的展示免疫治疗结果与病人风险高低之间的关系,如图: 2.数据 需要病人的高低风险分组,和免疫治疗结果 3.画图代码 因为数据是编的,就不用看high和low...
众所周知,今年TCGA数据库更新了一波,原来的HT-Counts现在变成了STAR-Counts。TCGABiolinks包的下载流程也发生了一些小小的变化。这里重新梳理一下...