这篇帖子的前身可以追溯到:玩转单细胞(2):Seurat批量做图修饰[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&mid...

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轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
转录因子(Transcription Factors,TFs),是指能够以特定序列与基因专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。转录因子通...
时代的洪流奔涌而至,单细胞技术也从旧时王谢堂前燕,飞入寻常百姓家。雪崩的时候,没有一片雪花是无辜的,你我也从素不相识,到被一起卷入单细胞天地。R语言和Seurat已以势如破竹...
--关于WGNCA的教程,本次的共有三期教程,我们同时做了三个分析的比较,差异性相对还是比较大的,详情可看WGCNA分析 | 你的数据结果真的是准确的吗??[https://...
练习数据集的GEO编号:GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
相关原理详细介绍生信技能树详解GSEA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247507922&id...
首先感谢Y叔的clusterprofiler神包,做富集分析优点是在线爬取数据,结果很可信,但是缺点也是网络问题,网络差点就要等很久,不过GSEA有自带GMT文件,因此下载好...
DAVID搞定功能通路富集分析 说起DAVID,没有涉及过高通的小伙伴们会以为这是一个人名,而对高通量稍有了解的人就会知道其实它是一款在线免费分析软件,主要用于差异基因的功能...
做通路富集分析常需要批量进行基因ID转换,总结了3种简便方法与大家分享。方法1和2依赖于基因组注释R包,如果无相应物种R包就必须用方法3。好在的是常用物种人、小鼠、大鼠等都是...
你不得不知道的GEO数据库芯片数据分析方法 大家好,我是阿琛。今天来给大家介绍一个新的专题内容---GEO数据库的使用方法。烹饪需要食材,分析需要数据。数据出发,整个研究的第...