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分离体分组混合分析法（Bulked Sergeant Analysis, BSA）也称为集群分离分析法或混合分组分析法，是从近等基因系分析法演变而来的。常规的育种通常从近等基...

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1. 软件安装 软件是python写的，不需要安装但是需要安装需要的库。 Numpy, Scipy, Matplotlib. 2. 输入文件要求 =====matrix格式的...

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SubPhaser原文链接：https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18173[https://nph.onl...

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写在前面 那天夏老师突然给我了一个电话，大体是提了这么一个想法，亦即，「BLAST Zone」挺好的，但如果可以加上「One Step ML Tree」似乎就更好了。当然，这...

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写在前面 今天周末，人在贵阳。BLAST Zone 这个功能，我太喜欢了。写出来之后，基本我天天用。主要原因还是简单，他确实比以前各个 BLAST GUI Wrapper 功...

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RIP和RNA pulldown都是研究RNA和蛋白相互作用的经典方法，只是出发点不一样而已。 RIP，RNA 结合蛋白便宜共沉淀，是从蛋白出发研究蛋白RNA相互作用的技术。...

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测序技术的飞速发展积累了大量转录组数据，从中也发现了很多新的转录本。区分这些转录本是蛋白编码序列还是非编码序列是基因组注释和新基因鉴定中的重要研究内容。但对于大量存在的无训练...

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在lncRNA机制研究里，有一小众人群在做SNP调控lncRNA表达，或功能改变的机制研究，不少CNS文章。SNP是突变位点，已报道许多重要的SNP与疾病密切关联。那么这些S...

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前言 MEGENA是一种基于图嵌入的方式构建基因共表达网络的工具，相比较于WGCNA的权重分析，MEGENA直接用图对嵌入来完成，因此更加接近于真实情况 MEGENA理论 O...

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导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...

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Ka，Ks（或Dn，Ds），这两个值以及他们的比值分别被赋予了一定的生物学意义。其中最为常用的是两者的比值，存在这么一种常见认知： ka/ks>>1 正选择 ka/ks~1 ...

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写在写在前面的前面 或许，没有人知道TBtools到底是什么？能干啥。但是看完这个推文，或许你就知道了其中的一部分。 写在前面 TBtools对外开放两年多，不时会有熟悉的不...

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森言森语 TBtools是一款优秀的生物信息学软件，也是我最早接触的生物信息学软件。从接触到现在差不多一年，边使用，边积累，算是学习路上的一款启蒙软件。有幸在我写公众号记录分...

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此视频来自B站，是非常好和全的的一个GWAS操作的视频，从开始准备软件下载，数据过滤，到最后的候选基因注释。GWAS的实战视频https://www.bilibili.com...

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本文是对WGCNA英文说明文档的翻译，英文的请查看这里[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/...