懦夫把困难举在头顶，英雄把困难踩在脚下
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『鹅厂号: 生信云笔记』分享生信分析及数据可视化相关的内容，欢迎关注和交流！<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2F1156054203.github.io" target="_blank">https://1156054203.github.io</a>
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非因生物是以空间多组学和靶向蛋白组学为核心技术、以癌症精准医学研究与临床整体解决方案为核心业务的创新型生物医学公司。
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一个对接CellPhoneDB的R包首先祝大家新年快乐！新的一年paper多多，顺顺利利！ cpplot:Visualize the results of cell-cell communication ana...
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公众号：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2读研，学习方向：癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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10X单细胞（10X空间转录组）之配受体联合TF因子的通讯分析(cellcall)hello，大家好，今天我们来分享一个更加重要的通讯方法，cellcall，规则很简单，就是我们在对单细胞进行通讯分析的时候，通讯到底有没有起到作用？？？之前的我分享的文章1...
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AI绘制封面-----肿瘤免疫治疗来，实现下面的图 首先第一步，养成好习惯 定好画板尺寸 右侧面板可调节具体数值 找到矩形工具 先来画黑色线框 左4，右4 最下方两个 然后找到椭圆工具 画出上方四个圆 然后填...
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R语言绘图之图片的局部放大（基础知识）下面这张图大家应该常见吧 一张图的局部放大，我们来实现一下， 示例数据 开始画图,先画散点图 好，开始局部放大 最后我们修改主题和风格 当然，可以进一步优化，比如把细胞注释的...
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AI绘制Cell封面细胞模型---高级AI的功能十分强大，CNS级别的杂志，几乎70%以上的文章是需要用AI这样的专业排版软件进行图片排版。同时一些复杂图形，比如细胞模型，也需要用AI进行绘制。我们这次的教程，以...
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利用AI绘制精美的基因代谢通路图（基础知识）年中总结接近尾声，我们学一学基础知识，利于我们文章的发表 通过KEGG富集分析得到通路图非常模糊，无法直接用于文章发表。而我们在一些大佬的文章里看到的通路图却非常漂亮，如下，...
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10X单细胞（10X空间转录组）轨迹分析（拟时分析）之基因开关（GeneSwitches）hello，大家好，今天给大家分享的是，拟时序轨迹分析软件中对轨迹关键驱动基因的下游分析，挖掘拟时序分化轨迹开关基因的分析，这个方面大家应该都不陌生，文章在GeneSwitc...
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10X单细胞（10X空间转录组）做WGCNA分析的智慧hello，大家好，今天给大家分享一些10X单细胞（10X空间转录组）做WGCNA分析时的一些东西，个人认为很重要，不过不得不承认的是，10X单细胞（10X空间转录组）做WG...
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10X单细胞目前大多数公司基本和高级分析汇总这次我们客套话就不讲了，直接上干货 列表汇总 我们来逐步看看（质控部分） 细胞聚类及可视化 样本/cluster差异分析 批次效应去除 细胞定义 Marker基因展示 拟时分...
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感觉无论是EmptyDrops算法call cell，还是 CellRanger V7以后分析默认包含内含子，都是为了让数据产出更好看，细胞捕获率高了，平均reads多了，但是很多低质量的数据都被包含进来了
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10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之细胞过滤那些事hello，大家好，今天已经是五一假期的第二天，本人呢，哪也去不了，只好在家歇着，所以呢，给自己找点事做，本人93年，单身，现居天津武清，女孩子有没有想谈恋爱了，可以联系我，...
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10X单细胞（10X空间转录组）SeuratPCA分析之三---维度的选取hello，大家好，今天我们来分享一下有关PCA维度选取的知识，深入探讨一下PCA维度选取的原理，我们首先需要知道的是单细胞PCA分析的降维原理[https://www.ji...
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Fisher 精确检验与卡方检验(10X单细胞和10X空间转录组的基础知识)
Fisher精确检验是基于超几何分布计算的，它分为两种，分别是单边检验（等同于超几何检验）和双边检验。 应用于将对象分成两组后的分类数据，以检查两组分类间是否有显著关系。 举...
