背景 目前市面上的肿瘤靶向用药基因检测Panel已非常常见，除了直观层面的gene种类、数目、捕获建库方法的不同外，对于肿瘤panel， 探针定制之初相关的MSI位点、...
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NGS基因检测Panel的探针设计 -
外显子（WES）panel分析基础篇作者，Evil Genius 我们来分享一下关于WES分析部分的内容，其中内容主要包括三部分 基础部分，包括WES数据的call SNP、INDEL、MSI、fusion、a...
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COSMIC数据库介绍——癌症研究者必看这是Sanger 研究所 2018 年 发表的在《Nucleic Acids Research》上的关于COSMIC v86 新版本的一篇文章，对 COSMIC 数据库功能和...
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NMPA肿瘤相关基因注册性能评价指导原则2019年12月05日国家药品监督管理局医疗器械技术审评中心发布了《肿瘤相关突变基因检测试剂（高通量测序法）性能评价通用注册技术审查指导原则》，该原则为NGS panel 的...
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一文搞懂——GATK MarkDuplicates 原理1 为什么要进行 MarkDuplicates 重复 reads 被定义为源自单个 DNA 模板的序列。临床应用场景下比如检测肿瘤的突变频率，当测序的reads中 发生/不发...
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关于肿瘤突变负荷（TMB）与panel设计--part1背景 随着2017年底MSK和FMI的两个大panel分别获得FDA批准；2018年国外——百时美施贵宝的欧狄沃（CFDA：非小细胞肺癌）、的科瑞达（CFDA：黑色素瘤...
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世和获批大Panel生信角度解析恭喜世和获得首个NGS 大Panel TMB检测试剂盒的审批。虽然现在不做肿瘤NGS检测方向了，但是看到行业内的公司首次走通大Panel审批流程还是心情激动，我之前在老东家曾...
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一代二代三代测序技术汇总The timeline of DNA sequencing History of genome sequencing Classification of DNA Seque...
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生物信息从业者，关注AI制药、癌症、微生物领域
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MSK-IMPACT 技术文档MSK-IMPACT (Integrated Mutation Profiling of Actionable Cancer Targets) 是美国纪念斯隆卡特琳癌症中心（...
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【临检杂谈】---盘点国内28家中国肿瘤液体活检公司！前言：2020 年 6 月 19 日，泛生子完成全球史上最大癌症精准医学 IPO。2020 年 6 月 12 日，燃石医学登陆纳斯达克，使其早期投资机构联想之星实现近 80 ...
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FoundationOne-CDx™ 技术文档与MSK-IMPACT 不包含任何伴随诊断不同，F1CDx 可以用于5 种肿瘤类型（包括 NSCLC、结直肠癌、乳腺癌、卵巢癌和黑色素瘤）15种靶向治疗的伴随诊断。F1CDx...
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NGS二代测序技术与转化医学研究--1.肿瘤体细胞突变部分NGS肿瘤体细胞突变检测 样本类型：组织样本（新鲜组织+石蜡切片）以及cfDNA样本 可查阅2017年 FDA批准的FoundationOne CDx™和MSK-IMPAC...
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8+非肿瘤生信，自测数据结合公共数据库结合免疫浸润，轻松发表！
大家好，今天要和大家分享的是2022年1月发表的一篇文章：“Comprehensive Landscape of Immune Infiltration and Aberra...
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最近7.7分SCI，单细胞分析+WGCNA+实验验证，有实验条件者可轻易模仿，肿瘤非肿瘤均适合！发表杂志：Biological Procedures Online 影响因子：7.71 生信分析咨询 请关注“生信小课堂”全网同名 研究背景： 结直肠癌(CRC)是全球癌症相...
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8+非肿瘤生信，WGCNA+机器学习+双疾病+单细胞，花式做生信！影响因子：8.78 关于非肿瘤生信，我们也解读过很多，主要有以下类型1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基因。2 单个疾病结合免疫浸润，热点基因集，机器学习算法等。3...
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最新8+非肿瘤生信，单细胞+WGCNA+机器学习+pcr验证，可模仿！
影响因子：8.78 关于非肿瘤生信，我们也解读过很多，主要有以下类型 1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基因。2 单个疾病结合免疫浸润，铁死亡，自噬等基因集，机器学...
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