作者，Evil Genius 关于OncoKB数据库 OncoKB(Precision Oncology Knowledge Base)网址：https://www.onco...
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OncoKB数据库介绍及爬虫爬取位点用药信息 -
拿到肿瘤NGS报告，如何选择用药？作者，Evil Genius 除夕了，龙年来了，结婚的人有点多，看来龙宝宝也会很多啊。 今年多灾多难，母亲也患了结肠癌动了手术，当然了，也做了NGS辅助后续治疗，对于肿瘤N...
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拿到肿瘤NGS报告，如何选择用药2？作者，Evil Genius 在上一篇提到了NGS报告的主体部分，这一篇我们要做一些报告解读上的补充。 首先第一点，MSI MSI上一篇提到主要跟免疫疗法的效果有关，但是在实...
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NGS肿瘤报告的免疫正负相关基因作者，Evil Genius~~~ 文章拿到肿瘤NGS报告，如何选择用药？[https://www.jianshu.com/p/883d5456e476]、拿到肿瘤NGS报告...
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NGS基因测序（panel）报告解读数据库汇总作者，Evil Genius 今天我们来梳理一下肿瘤基因报告解读常见的数据库，大家有机会可以自己查询并且解读，涉及到的数据库有dbSNP数据库 、gnomAD数据库、ExA...
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CIVIC数据库详细梳理作者，Evil Genius 特检和肿瘤早筛真的是不能马虎一点。 civic官网，https://civicdb.org/welcome[https://civicdb.or...
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肿瘤特检关于cancer hotspot的简单记录作者，Evil Genius 在做肿瘤特检报告的时候，经常会出现像针对基因的mutation、针对外显子的插入缺失，比如EGFR Exon 19 Deletion等，但还有像...
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外显子拷贝数分析之cnvkit作者，Evil Genius 跟美国人交流的时候，讨论起外显子的CNV检测，国内用的cnvkit居多，但是我翻了很多的推文，感觉都写的很肤浅，美国人问到的问题都比较深入，涉及...
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COSMIC数据库详细梳理作者，Evil Genius 目前COSMIC数据库已经更新到了v100版本 cosmic所有的文件解读 Cosmic_Breakpoints_Tsv_v100_GRCh37...
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单细胞空间外显子资料梳理作者，Evil Genius 马上国庆了，我们就简单汇总一下过去的经验和资料，为4季度冲刺做准备吧。 盗版好像都已经有了，虽然我得不到任何好处，但是希望大家拿到之后好好珍惜、...
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因为简书平台近期更新不了，近期会在语雀更新。。。继续生信学习
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find me on that green bird<br>也可以发邮件 louiesxscape(AT)gmail.com
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生信工作者。
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爱生活爱学习爱运动的超级无敌郑一一同学。偶尔郁闷，偶尔低沉，但大多数都是积极向上。慢慢学会认识自己的不足，坦然接受自己的平凡，努力去做好手头上的工作，并慢慢去探寻自己喜欢并且热爱的东西。如果我的一辈子注定平凡，那么希望自己享受着平凡而美好的生活
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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外显子（wes）panel数据分析OncoKB注释作者，Evil Genius 接下来我们进行第二步，对外显子突变信息进行OncoKB注释，为第三步用药指导做充分的准备。我们进行的分析从annovar注释后的结果开始，这里注...
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NGS基因检测Panel的探针设计背景 目前市面上的肿瘤靶向用药基因检测Panel已非常常见，除了直观层面的gene种类、数目、捕获建库方法的不同外，对于肿瘤panel， 探针定制之初相关的MSI位点、...
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外显子（WES）panel分析基础篇作者，Evil Genius 我们来分享一下关于WES分析部分的内容，其中内容主要包括三部分 基础部分，包括WES数据的call SNP、INDEL、MSI、fusion、a...
