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Cytoscape基础教程笔记
转自：https://www.plob.org/article/6289.html 昨天开始学用Cytoscape，其tutorial分为两个部分，基础的和高级 的。基础教程...
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WGCNA：选择某个模块绘制共表达网络前面的教程已经进行了WGCNA分析并将各个模块的网络图绘制文件导出，接下来将进行共表达网络的绘制，本次教程依旧根据PlantTech的Cytoscape课程[https://...
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networkx + Cytoscape 构建及可视化网络图本次笔记内容：网络图的简要结构以相关系数表为例：networkx构建网络结构Cytoscape可视化网络图co-XXX network 网络图的简要结构 网络结构由点及连接点...
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Cytoscape可视化相关性结果两个指标的相关性表示方法很多，此处介绍Cytoscape软件可视化相关性结果的步骤。这里展示基因与转录因子的相关性结果。 先看成图 步骤1.计算两者相关性，整理成如下表格： ...
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转录组不求人系列(二): 公共数据库数据挖掘
截至目前，无论是人的还是其他生物的，一些常见疾病还是模型都进行过转录组测序，而且测序数据已经上传至公共数据库，如果自己的研究中恰好需要一些组学数据支持，或者课题研究需要从组学...
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差异基因火山图：ggplot2+ggrepelggrepel参考[https://www.jianshu.com/p/84e7e0e029cd]火山图参考[https://www.jianshu.com/p/413751...
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【R语言】DAVID KEGG富集分析结果可视化小编前面也用了好几期的内容来给大家分享如何零代码做GO和KEGG富集分析，主要用到的是DAVID这个网页工具，并且零代码展示GO和KEGG富集分析的结果，主要用到的是Exce...
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8 注释数据库KEGG和GO注释数据库KEGG和GO KEGG KEGG数据库网址[https://www.genome.jp/kegg/] KEGG FTP服务器[ftp://ftp.genome.j...
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R包clusterProfiler: 转换ID、GO/KEGG富集分析参考这篇ID转换不用怕，clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办，值得一看 简单介绍一下几种常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG开头...
