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    Cytoscape可视化相关性结果

    两个指标的相关性表示方法很多,此处介绍Cytoscape软件可视化相关性结果的步骤。这里展示基因与转录因子的相关性结果。 先看成图 步骤1.计算两者相关性,整理成如下表格: ...

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    WGCNA(6):筛选 hub gene

    通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA(3):基因模块与性状关联识别重...

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    知识分享| 转录组个性化分析(5)——转录因子及转录因子结合位点预测

    转录因子也称反式作用因子,在动植物的生长发育及其对外界环境的反应中起着重要的调控作用,已成为现在生物学研究领域的热点,其功能分析是重要的研究内容之一。因此我们可以通过...

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    RNA-seq数据的基因共表达网络分析

    刘小泽写于18.10.24最近开始写第一篇英文小论文,练练手,为将来写英文大论文做准备 目录 1 背景 Background Types of biological netw...

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    收藏贴之一 | 写过热图工具的人,给你理清热图数据标准化

    写在前面 热图,或称热力图,是外文 Heatmap 的直译。在几乎所有数值分析相关工作中都可以看到。生物信息学数据,自然躲不过。无论是形态数据,还是基因拷贝数数据,或是基因表...