【2017 PCP】CRISPR/Cas9编辑AtCLE肽家族的表型

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概括

     在拟南芥系统中,用CRISPR/Cas9,对所有的32CLE 基因进行编辑敲除,clv3和cle40与之前已有的报道表型吻合,说明编辑的可行性,在cle44突变体中,观察到原形成层细胞减少的表型,并且在cle41 cle44双突中该表型具有加性效应。给出进化树和gRNA设计位置

内容

  1. CLE 在早期陆地植物的基因组中就已经存在
  2. 拟南芥中鉴定出32个CLE 基因(2016年)
  3. CLE前体包括N端分泌信号肽,中间可变区,C端功能区,在转录翻译结束后进入分泌通路,N端信号肽被切除,C端被蛋白酶水解后,生成成熟的CLE
  4. CLV3抑制干细胞增殖,clv3干细胞增多,此处clv3角果短棒状,心皮数目增加
  5. cle40根尖小柱细胞分化推迟,小柱干细胞增多
  6. cle41在下胚轴中原形成层细胞减少,木质部增多
  7. cle41 cle44对原形成层的抑制具有加性效应
  8. 由于CLV3受到CLV-WUS的反馈调节,所以在clv3突变体中,尽管clv3突变,QRT-PCR检测CLV3的mRNA仍然是升高的【检测的是该缺陷型mRNA吧,不然完整的CLV3已经被编辑了么】。在cle41 cle44单突双突中,CLE41 CLE44的mRNA水平没有受到影响【这是想表达什么意思呢,是想说,基因被编辑之后,转录可能不会受到影响,仍然会转录出编辑后的mRNA,但是该mRNA在蛋白水平上的功能却无法实现。就是说对于CLE的编辑,用QRT-PCR检测,一般是没有差异的?】
  9. 所有的cle单突没有发育缺陷
  10. 方法:
    Cas9系统:Gene-targeting vectors were constructed based on the pDe-Cas9 systems pro-vided by Holger Puchta (Fauser et al. 2014)
    gRNA设计网址:. Gene-specific gRNA sequences were designed using tools at the CRISPRdirect website (https://crispr.dbcls.jp/) (Naito et al. 2015)

进化树、靶点设计

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文献原文
Plant Cell Physiol. 58(11): 1848–1856 (2017) doi:10.1093/pcp/pcx139, Advance Access publication on 25 September 2017

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